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CPHI制藥在線(xiàn) 資訊 小泥沙 套索肽的結構分類(lèi)及其功能應用研究進(jìn)展

套索肽的結構分類(lèi)及其功能應用研究進(jìn)展

熱門(mén)推薦: 套索肽 抗菌 結構
作者:小泥沙  來(lái)源:CPHI制藥在線(xiàn)
  2023-07-13
近年來(lái),隨著(zhù)質(zhì)譜分析等技術(shù)的改進(jìn)及基因組測序的發(fā)展,對套索肽的序列和結構多樣性得到了充分認識,對于套索肽生物合成機制也有了更深入的了解,但套索肽的生物合成及其合成相關(guān)修飾酶的異源表達純化依然面臨巨大挑戰。

       套索肽是一類(lèi)由核糖體合成和翻譯后修飾的活性肽(RiPPs),因具有互鎖套索拓撲結構特征而得名。其帶有螺旋結構的C端穿過(guò)N端的內酰胺環(huán)而形成互鎖套索樣的結構,其中N端的肽環(huán)通常由7 ~ 9個(gè)氨基酸組成。大多數套索肽N末端的氨基酸殘基通常為甘氨酸(Gly)、絲氨酸(Ser)、半胱氨酸(Cys)或丙氨酸(Ala),但近期也發(fā)現了N末端氨基酸為亮氨酸(Leu)的新型套索肽。套索肽大的肽環(huán)在 N-末端的氨基酸的α-氨基與天冬氨酸(Asp)或谷氨酸(Glu)的羧酸側鏈之間形成。這種結構賦予了套索肽對化學(xué)、熱和蛋白酶降解高度的穩定性。

       套索肽的結構及分類(lèi)

       根據套索肽所含二硫鍵的數量和形成的位置不同可將其分為4類(lèi),如下圖所示。C 端肽鏈與大肽環(huán)通過(guò)2個(gè)二硫鍵連接的套索肽被定義為Ⅰ類(lèi)套索多肽(Class I);若肽鏈尾在穿出肽環(huán)之后,C 端肽鏈與大肽環(huán)間無(wú)二硫鍵連接,而是通過(guò)空間相互作用穩定套索拓撲結構,則被稱(chēng)為Ⅱ類(lèi)套索多肽(Class II);若肽鏈尾C端方向序列與肽環(huán)之間只形成一個(gè)二硫鍵的套索多肽,根據其二硫鍵形成位置不同,分為Ⅲ類(lèi)或Ⅳ類(lèi)套索肽(Class III,Class IV),具體而言,Ⅲ類(lèi)套索肽的二硫鍵將肽環(huán)與肽鏈尾相連接,而Ⅳ類(lèi)的二硫鍵僅存在于肽鏈尾。其中,II 類(lèi)套索肽是目前已知的套索肽中最常見(jiàn)且最 具有特征性的套索肽,通常來(lái)源于變形菌,Ⅰ類(lèi)、Ⅲ類(lèi)和Ⅳ類(lèi)套索肽則通常來(lái)源于放線(xiàn)菌。來(lái)源變形菌的Ⅱ類(lèi)套索肽通常具有極性親水性,從鏈霉菌中分離出來(lái)的Ⅰ類(lèi)套索肽和Ⅱ類(lèi)套索肽(如 MccJ25、propeptin 和anantin)則為疏水性,正是這些結構特征決定了套索肽所具有的多種生物活性。

根據套索肽所含二硫鍵的數量和形成的位置不同可將其分為4類(lèi)

       (黃色區域代表二硫健,來(lái)源參考資料[1])

       套索肽的功能應用

       至今為止,已有報道稱(chēng)某些套索肽如鏈霉菌來(lái)源的套索肽 Siamycin 等可在糖尿病的治療、靶向與癌癥有關(guān)的受體如內皮素 β 受體等中發(fā)揮作用,同時(shí) Microcin J25 也被報道具有抗菌及受體拮抗劑等生物活性。

       1、抑菌活性

       目前已發(fā)現的大部分套索肽是在變形桿菌和放線(xiàn)菌中合成的,如羊毛硫細菌素、小菌素、微環(huán)素、藍內酯和硫肽等。大多數套索肽都具有抗細菌的作用。許多羊毛硫抗生素對多種革蘭陽(yáng)性菌具有殺菌作用,有些對耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌(MRSA)、耐萬(wàn)古霉素腸球菌和耐奧沙西林的革蘭陽(yáng)性菌等具有較好的活性。套索肽 MccJ25 對于革蘭陰性菌(如大腸埃希菌和沙門(mén)菌等)有殺傷作用,同時(shí)能夠中和內毒素,并通過(guò)其免疫調節作用抑制炎癥細胞因子的產(chǎn)生;活性肽MccJ25 還可以防止由腸毒素ETEC K88 引起的腸道損傷和炎癥反應,可作為一種新的預防性藥物來(lái)減少動(dòng)物、食品或人類(lèi)的病原體感染。來(lái)源于鏈霉菌屬 Streptomyces sannurensis的套索肽 marinopyrroles A-F 對 MRSA 也具有極強的抗菌活性。目前認為套索肽的抗菌作用主要是通過(guò)2 種機制:其一是作用于細菌的細胞膜,在膜上形成離子通道,引起胞內物質(zhì)的外漏而殺死細菌;其二是套索肽不破壞細胞膜而進(jìn)入胞內,與胞內靶標結合后抑制其謝,從而殺死細菌。例如,MccJ25 與細菌外膜受體蛋白 FhuA 結合,進(jìn)入細菌后抑制 RNA 聚合酶的作用,起到殺菌的作用。

       2、受體拮抗劑

       來(lái)源于Streptomyces sp 的套索肽RES-701-1 是內皮素受體ETB 的選擇性拮抗劑。目前某些內皮素的肽類(lèi)拮抗劑由于胃腸道的降解作用而限制了其治療作用,而通過(guò)將套索肽 RES-701-1 序列來(lái)改造設計對蛋白水解具有更高穩定的肽類(lèi)拮抗劑成為近年來(lái)的研究熱點(diǎn)。由Streptomyces coulescens 產(chǎn)生的套索肽Anantin 是第一個(gè)由微生物產(chǎn)生的心房利鈉因子拮抗劑( Atrial natriuretic factor antagonist ANP)。利鈉肽( NPs) 是一種參與維持滲透壓與血管穩態(tài)的激素,能引起利鈉、利尿和血管舒張作用,它還顯示出抗纖維化、抗增殖和抗增生作用,并參與心臟和血管系統的重塑。Burkholderia thailandensis 來(lái)源的套索肽 BI-32169 是胰高血糖素受體的強拮抗劑,同時(shí)也是第一個(gè)序列與胰高血糖素非同源的天然肽類(lèi)拮抗劑,其一級結構與胰高血糖素有很大不同,因此涉及到 BI-32169 的拮抗作用機制目前還不清楚。由于胰高血糖素受體的肽類(lèi)拮抗劑普遍的低穩定性,其在治療方面上的應用也遠遠少于小分子有機物,而套索肽中套索結構及其特殊的結構特性使得其可為開(kāi)發(fā)新的肽類(lèi)拮抗劑提高穩定性。

       3、酶抑制劑

       Streptomyces griseoflavus 來(lái)源的套索肽 MS-271 是平滑肌肌球蛋白輕鏈激酶(Myosin light chain kinase,MLCK) 的抑制劑,通常肽類(lèi)抑制劑具有更好的特異性,但由于肽在體內的低穩定性限制了其應用,而套索肽類(lèi)抑制劑由于其結構特性所具有的穩定性也為 MLCK 抑制劑藥物的研發(fā)提供了新思路。由 Microbispora sp. SNA-115 產(chǎn)生的套索肽propeptin 是一種絲氨酸蛋白酶抑制劑。研究表明,Propeptin 作為絲氨酸蛋白酶抑制劑類(lèi)已在動(dòng)物模型中顯示具有保護神經(jīng)、抗遺忘以及認知增強的作用。MccJ25和Capistruin 是由 Proteobacteris 產(chǎn)生的通過(guò)抑制RNA 聚合酶(RNAP) 活性從而抑制細菌的套索肽。細菌RNAP(RNA 聚合酶,RNA polymerase) 是抗生素作用的重要靶點(diǎn),它對細菌的生長(cháng)和生存至關(guān)重要,同時(shí)在細菌中較為保守,使得其可以在不影響真核生物RNAP 的情況下被選擇性靶向。Mukhopadhyay等的研究表明,Mccj25 通過(guò)于RNAP 二級通道菌的結合來(lái)阻斷底物與活性中心的作用來(lái)抑制轉錄。

       4、分子支架

       目前,肽類(lèi)藥物被廣泛應用于臨床治療,與小分子藥物相比,它們具有更高的靶向性,并且與以往的基于蛋白質(zhì)的治療相比,它們表現出較低的免疫原性。然而,傳統的多肽藥物由于其溶解度低、生物利用度低、穩定性差等特點(diǎn),其應用往往受到限制。為了解決這一問(wèn)題,通過(guò)將天然產(chǎn)生的具有穩定結構的套索肽作為一種分子支架用于表位移植開(kāi)發(fā)肽類(lèi)藥物成為了其中一個(gè)解決方案。在很多腫瘤細胞中,整合素表面αvβ3亞基中的Arginine, Glycine 和 Aspartic(RGD) 是過(guò)表達的,用RGD 替換 MccJ25 中的 G12、I13 和G14 形成的雜交肽可用于癌癥識別和治療。RES-701-1具有內皮素 B 受體拮抗功能,由內皮素和RES-701-1 組成的雜交肽對ETB 的親和力和拮抗作用得到明顯提高。此外,將RGD 序列整合到RES-701-1中可以提高其生物活性和結構穩定性。通過(guò)對套索肽環(huán)和尾部區域進(jìn)行修飾,可使其獲得新的生物活性。遺憾的是,截至目前,套索支架仍不能通過(guò)化學(xué)合成方法獲得,只能依賴(lài)于套索肽生物合成修飾酶的作用,而套索肽生物合成修飾酶的難于異源表達純化也為這一應用帶來(lái)了挑戰。

       套索肽是一類(lèi)由核糖體合成并經(jīng)翻譯后修飾、具有套索結構的天然肽。特殊的拓撲結構賦予該類(lèi)肽超強的耐理化及蛋白酶水解的穩定性。近年來(lái),隨著(zhù)質(zhì)譜分析等技術(shù)的改進(jìn)及基因組測序的發(fā)展,對套索肽的序列和結構多樣性得到了充分認識,對于套索肽生物合成機制也有了更深入的了解,但套索肽的生物合成及其合成相關(guān)修飾酶的異源表達純化依然面臨巨大挑戰。若能夠通過(guò)化學(xué)合成和基因重組對套索肽進(jìn)行定向修飾改造將進(jìn)一步拓展套索肽在醫療領(lǐng)域的應用。

       參考資料

       [1]成騁,華子春.套索肽——一種可供多肽類(lèi)藥物設計和改造的多功能載體[J].藥學(xué)進(jìn)展,2019,43(10):777-785.

       [2]李欣芮,陸美玲.套索肽研究進(jìn)展[J].藥物生物技術(shù),2020,27(06):587-593.

       作者簡(jiǎn)介:小泥沙,食品科技工作者,食品科學(xué)碩士,現就職于國內某大型藥物研發(fā)公司,從事?tīng)I養食品的開(kāi)發(fā)與研究。

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