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CPHI制藥在線 資訊 小泥沙 人類諾如病毒及其小分子抑制劑研究進展

人類諾如病毒及其小分子抑制劑研究進展

作者:小泥沙  來源:CPHI制藥在線
  2025-05-30
人類諾如病毒(Human norovirus,HuNoV),也被稱為諾瓦克病毒,是全球急性胃腸炎的主要原因之一。

病毒

       人類諾如病毒(Human norovirus,HuNoV),也被稱為諾瓦克病毒,是全球急性胃腸炎的主要原因之一。HuNoV影響所有年齡組,具有高度傳染性,特別是免疫系統(tǒng)較弱的人群,并可能導(dǎo)致嚴重的臨床后果。由于 HuNoV 具有遺傳變異大、進化快的特點,這給抗病毒藥物的研發(fā)造成了極大挑戰(zhàn)。在全球范圍內(nèi),大多數(shù)胃腸炎病例是由大流行性 GII.4 人類諾如病毒(HuNoV)毒株引起的。據(jù)估計,諾如病毒每年導(dǎo)致約 6.84 億人患病,約 21.2 萬人死亡。衛(wèi)生系統(tǒng)和社會直接成本每年超過600 億美元。作為一種傳染性極強的腸道病原體,其對全球公共衛(wèi)生造成重大威脅,引起了國際上的廣泛關(guān)注。目前,還沒有批準的疫苗和針對 HuNoV 的特異性治療方法。

       諾如病毒(Norovirus,NoV)是無包膜的單股正鏈 RNA 病毒。HuNoV的RNA 基因組長約 7.7 kb,其基因組由三個開放閱讀框(ORF)組成:ORF1 編碼一個多聚蛋白,該蛋白被病毒蛋白酶裂解為六個非結(jié)構(gòu)蛋白,其中包括 RNA 依賴的 RNA 聚合酶(RdRp),這是一種促進病毒 RNA 復(fù)制的關(guān)鍵酶;ORF2 編碼主要衣殼蛋白 VP1,該蛋白結(jié)構(gòu)上分為S和 P區(qū)兩個相鄰的區(qū)域,其中 S區(qū)形成內(nèi)核,構(gòu)成 VP1 的底座;P 區(qū)形成拱樣結(jié)構(gòu)突出于內(nèi)核外,可進一步分為 P1和P2亞結(jié)構(gòu)域;ORF3 編碼次要衣殼蛋白VP2,VP2具有穩(wěn)定病毒顆粒的作用。根據(jù)VP1 的氨基酸序列,NoV 被分類為至少10個基因組(GI-GX),這些基因組進一步細分為49個基因型。在可感染人類的五種基因組(GI、GII、GIV、GVIII和GIX)中,GI 和GII 突變體是導(dǎo)致腸胃炎病例的主要病原體。特別是 GII.4 基因型長期以來一直是全球胃腸炎暴發(fā)的主要原因,其變體每隔 2-4 年就會進化成新的變體,因其高傳染性和引發(fā)大規(guī)模流行病的能力而聞名。

       NoV基因組測序有助于開發(fā)基于核酸的NoV 檢測方法。20世紀90年代中期,第一個以 ORF1 中RNA 聚合酶基因相對保守區(qū)為靶點的 RT-PCR 被用于檢測 NoV。此后,針對 NoV開發(fā)了更多實時、快速和靈敏的分子檢測方法,包括 RT-qPCR、微滴數(shù)字 RT-PCR、多重 RT-PCR、巢式 PCR、高通量測序基因芯片、逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫擴增法等。通過靶向檢測ORF1-ORF2 連接處的保守基因組區(qū)域,發(fā)現(xiàn)基于實時核酸的方法比抗原檢測分析更靈敏、更具廣泛的反應(yīng)性。普通 RT-PCR 在電泳過程中易交叉污染。多重 RT-PCR 雖然具有同時檢測多種目標分子的優(yōu)點,但容易發(fā)生非特異性擴增。巢式 PCR 無法對病毒定量,耗時長且容易發(fā)生交叉污染。近年來,普通 RT-PCR、多重 RT-PCR 等逐步被新方法取代。

       諾如病毒小分子抑制劑

       人類諾如病毒抗病毒藥物早期研究的進展緩慢,很大程度上是由于其細胞培養(yǎng)系統(tǒng)的建立困難。直到2016 年,人類諾如病毒在源自干細胞的人腸上皮細胞(human intestinal enteroids, HIEs)中的培養(yǎng)系統(tǒng)才初步建立,但 HIEs 系統(tǒng)中的病毒復(fù)制量僅為670倍,其有限的病毒復(fù)制量仍是研究疫苗和藥物的障礙(諾如病毒在B細胞系中的復(fù)制量更低)。此外,人類諾如病毒具有物種特異性,無法感染其他物種。此前對人類諾如病毒的認知主要基于其他杯狀病毒研究,例如通過鼠諾如病毒在細胞培養(yǎng)和小鼠模型中篩選潛在抗病毒藥物。在腸道類器官培養(yǎng)模型中篩選諾如病毒抑制劑成為開發(fā)慢性感染治療的新策略,許多廣譜抗病毒藥物已在實驗中表現(xiàn)出對諾如病毒的抑制活性。

       1、RNA 聚合酶抑制劑

       HuNoV的RNA 依賴的 RNA 聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)在病毒基因組的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,成為抗病毒治療的重要靶點。RdRp是一種用于病毒復(fù)制的酶,在RNA 病毒中高度保守,且在哺乳動物細胞中無同源蛋白,是抗病毒藥物研究的重要靶點。HuNoV 的RdRp 結(jié)構(gòu)類似于其他正鏈 RNA 病毒,具有右手型結(jié)構(gòu),包括手指、手掌和拇指子結(jié)構(gòu)域,以及連接手指和拇指的 N端結(jié)構(gòu)域。手指和拇指子結(jié)構(gòu)域協(xié)作包圍手狀結(jié)構(gòu),形成單鏈模板 RNA 的通道。

       ①核苷類抑制劑

       RNA依賴性RNA 聚合酶(RdRp)是治療諾如病毒感染的重要靶點。核苷類抑制劑(nucleoside inhibitors, NIs)作為底物類似物,通過競爭性抑制終止 RNA 合成,通常表現(xiàn)出廣譜抗病毒活性。目前發(fā)現(xiàn),針對其他 RNA 病毒開發(fā)的核苷抑制劑也可用于諾如病毒感染治療。

       法匹拉韋(favipiravir, T-705)是一種前藥,在體內(nèi)快速轉(zhuǎn)化為法匹拉韋三磷酸,通過競爭性抑制病毒復(fù)制轉(zhuǎn)錄并誘發(fā)致命突變。該藥物已在部分國家廣泛用于流感治療,并在埃博拉病毒、COVID-19及拉沙熱的治療中發(fā)揮作用。法匹拉韋作為嘌呤類似物,可抑制人類諾如病毒復(fù)制子。實驗表明其對鼠諾如病毒具有療效,在小鼠模型中通過抗病毒誘變降低病毒載量,并觀察到突變頻率增加及病毒 RNA 傳染性降低。然而,法匹拉韋可能在小鼠和患者體內(nèi)誘導(dǎo)誘變,用于慢性諾如病毒感染存在潛在風險。

       利巴韋林(ribavirin)是廣譜抗病毒藥物,對DNA和RNA病毒均有效,臨床用于呼吸道合胞病毒、流感、拉沙熱、肝炎及麻疹治療。利巴韋林通過抑制RdRp發(fā)揮作用,對鼠諾如病毒抑制效果顯著,是當前治療諾如病毒感染的主要藥物,尤其在原發(fā)性免疫缺陷患者的慢性感染中療效顯著。但其與硝唑尼特聯(lián)用效果存在爭議,部分臨床數(shù)據(jù)顯示療效欠佳

       2′-FdC(2′-fluoro-2′-deoxycytidine)是核苷類似物,其通過轉(zhuǎn)化為 2′-FdC-三磷酸(FdCTP)并入細胞 DNA/RNA,抑制病毒復(fù)制,對HCV、拉沙病毒及克里米亞-剛果出血熱病毒等均有效。研究發(fā)現(xiàn),在RAW264.7小鼠巨噬細胞模型中,2′-FdC 能有效抑制鼠諾如病毒傳播。能夠顯著降低 RAW264.7 細胞中 MNV-1 的病毒RNA和NS1/2 蛋白表達。使用 100 μmol·L-1的 2′-FdC 處理后,諾如病毒滴度降低,其抑制 MNV-1 復(fù)制的 IC50 值為 20.92 μmol·L-1,RAW264.7 細胞中 2′-FdC 的CC50 值為 1.768 mmol·L-1。為進一步驗證 2′-FdC 的功效,研究人員測試了急性清除菌株 MNVCW3 和持續(xù)性菌株 MNVCR6,結(jié)果顯示 2′-FdC 同樣能抑制兩種病毒株的 RNA 復(fù)制及蛋白表達。

       2′-C-甲基胞苷(2′-C-methylcytidine, 2CMC)最初作為抗 HCV 藥物開發(fā),但其前藥 Valopicitabine 因胃腸道副作用終止臨床研究。然而,2CMC仍被報道為潛在抗諾如病毒藥物。研究表明,2CMC 可抑制鼠諾如病毒形成及RNA合成,并在小鼠模型中減少病毒脫落及傳播。在人類諾如病毒 BJAB 細胞培養(yǎng)系統(tǒng)中,2CMC的EC50值為0.3 μmol·L-1。研究人員評估了2CMC衍生物,如2FCMC、N-羥基胞苷NHC的活性。在 RAW264.7 細胞中,2CMC 和2FCMC 的EC50 分別為 6.9 μmol·L-1和 12.7 μmol·L-1,而 NHC 和拉米夫定無顯著抑制。在 HG23 細胞中,2CMC、NHC和2FCMC的EC50分別為1.3 μmol·L-1、1.5 μmol·L-1和3.2 μmol·L-1。目前研究聚焦于開發(fā)更安全的 2CMC 衍生物。

       4-氨基吡咯[2,1-f][1,2,4]三嗪核苷衍生物具有顯著抗諾如病毒活性。其通過修飾糖基和堿基獲得系列衍生物,其EC50為0.007~11 μmol·L-1,CC50 為0.01~23.7 μmol·L-1。盡管存在細胞毒性,但其雙重抗小鼠和人類諾如病毒活性為后續(xù)優(yōu)化提供了基礎(chǔ)。

       NCT(5-硝基胞苷三磷酸)最初作為抗脊髓灰質(zhì)炎病毒藥物被發(fā)現(xiàn),其抑制 RdRp活性優(yōu)于利巴韋林。過X射線晶體學測定了諾如病毒聚合酶與NCT結(jié)合的高分辨率結(jié)構(gòu)。該結(jié)構(gòu)顯示,RdRp被包裹在一個包含互補引物模板RNA和兩個金屬離子的三元復(fù)合物中。NCT分子占據(jù)核苷酸結(jié)合位點,通過競爭性抑制導(dǎo)致RNA鏈終止,但其抑制諾瓦克病毒復(fù)制的潛力仍需更多實驗驗證。

       ②非核苷類抑制劑

       非核苷類抑制劑(non-nucleoside inhibitors, NNIs)通過與RdRp變構(gòu)位點結(jié)合,終止復(fù)制所需的構(gòu)象變化。目前NNIs主要針對HCV或HIV開發(fā),尚無專門針對人類諾如病毒的上市藥物。

       蘇拉明(suramin)通過脂質(zhì)體遞送可抑制鼠諾如病毒復(fù)制,但其臨床應(yīng)用受限于藥代動力學和毒性問題。其衍生物PPNDS最初作為P2X1受體激動劑,后證實對人諾如病毒和MNV RdRp具有強效抑制。PPNDS通過結(jié)合RdRp的NAF2位點廣泛抑制轉(zhuǎn)錄活性。在10 μmol·L-1濃度下,PPNDS對貓諾如病毒聚合酶的IC50達2.7 μmol·L-1。然而,蘇拉明及PPNDS因細胞通透性差和非特異性脫靶活性,需進一步優(yōu)化以克服研發(fā)障礙。

       近年研究發(fā)現(xiàn),HCV NNIs如JTK-109可通過結(jié)合Thumb I位點(Q414和R419)抑制杯狀病毒科,如諾如病毒屬、沙波病毒屬和拉戈病毒屬等6個RdRp的轉(zhuǎn)錄活性,其抑制諾如病毒RdRp的IC50為4.3~16.6 μmol·L-1。

       NIC02、NIC04、NIC10和NIC12化合物也是潛在的藥物支架。通過GTP摻入法動力學研究發(fā)現(xiàn),NIC02和NIC04可同時結(jié)合游離酶及酶-底物復(fù)合物。而NIC10和NIC12只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合,因此可能與底物結(jié)合位點不同的變構(gòu)口袋結(jié)合,所以NIC02和NIC04、NIC10和NIC12在諾如病毒RdRp中可能占據(jù)不同的結(jié)合位點。

       2、3C樣蛋白酶抑制劑

       諾如病毒3C樣蛋白酶(3CLpro)是一種半胱氨酸蛋白酶,其核心結(jié)構(gòu)與胰凝乳蛋白酶類似,由N端反平行β折疊和C端β桶結(jié)構(gòu)域組成?;钚晕稽c位于兩結(jié)構(gòu)域間裂口處,催化三聯(lián)體(Cys139、His30、Glu54)特異性識別P1 Gln殘基,負責病毒多蛋白裂解,生成結(jié)構(gòu)與非結(jié)構(gòu)蛋白。因此,3CLpro是抗諾如病毒藥物設(shè)計的重要靶點。

       蘆平曲韋(rupintrivir)最初針對人類鼻病毒3CLpro開發(fā),近期研究顯示其可抑制人類諾如病毒3CLpro,EC50為(0.3 ± 0.1)μmol·L-1,EC90為(1.5 ± 0.2)μmol·L-1。但A105V和I109V突變可降低病毒對蘆平曲韋的敏感性,耐藥機制尚不明確。

       GC376 等一系列 3CLpro 過渡態(tài)抑制劑。過渡態(tài)類似物競爭性抑制劑在分子結(jié)構(gòu)上與底物相似,在酶促反應(yīng)中,抑制劑和底物競爭與酶的活性中心結(jié)合。過渡態(tài)抑制劑目前可分為兩類,一類是肽基化合物(如 GC376),研究人員利用諾如病毒蛋白酶在谷氨酰胺-甘氨酸肽位點裂解的特點,通過谷氨酰胺替代物發(fā)揮抑制作用。基于此結(jié)構(gòu)開發(fā)的一系列變體均顯示出高水平抗病毒活性。另一類是大環(huán)化合物,作為肽基抑制劑的結(jié)構(gòu)修飾版本,旨在提高膜透性和口服生物利用度以增強臨床適用性。盡管其效果不及肽基抑制劑,但表現(xiàn)出對 RNA 病毒的廣譜抗病毒活性。

       3、未知作用靶點藥物

       硝唑尼特(nitazoxanide, NTZ)最初作為抗寄生蟲藥物開發(fā),后證實具有廣譜抗病毒活性,臨床用于流感及諾如病毒感染治療。硝唑尼特作為新型藥物的支架參與病毒復(fù)制的宿主調(diào)節(jié)過程。硝唑尼特生物利用度高且十分安全,具有豐富的上市后經(jīng)驗,超過7500萬成人和兒童服用過此藥物。而目前有多項臨床實驗表明,硝唑尼特對于治療諾如病毒感染具有顯著療效。目前,其新型制劑正在進行全球III期臨床試驗,可抑制輪狀病毒、冠狀病毒、登革熱病毒等多種RNA/DNA病毒。

       參考資料

       [1]劉陽.靶向人類諾如病毒RdRp的小分子抑制劑的發(fā)現(xiàn)及生物活性評價[D].浙江中醫(yī)藥大學,2024.

       [2]普春敏,陳麗麗,索玉娟,等.食品中諾如病毒的分離、富集與分子檢測技術(shù)研究進展[J].上海農(nóng)業(yè)學報,2024,40(05):131-141.

       [3]孫睿陽,劉永祥,鐘武.小分子諾如病毒抑制劑的研究進展[J].沈陽藥科大學學報,2023,40(12):1656-1665.

       作者簡介:小泥沙,食品科技工作者,食品科學碩士,現(xiàn)就職于國內(nèi)某大型藥物研發(fā)公司,從事營養(yǎng)食品的開發(fā)與研究。

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