北京大學(xué)謝曉亮院士團(tuán)隊(duì)發(fā)表y有關(guān)單細(xì)胞 Micro-C的最新Nature Genetics論文

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來(lái)源：生物世界

2025-07-08

在動(dòng)物基因組中，被稱為增強(qiáng)子（enhancer）的調(diào)控性 DNA 元件控制著特定細(xì)胞類型中基因表達(dá)的精確時(shí)空模式。然而，增強(qiáng)子在細(xì)胞核內(nèi)的空間組織以調(diào)控靶基因的方式，目前仍知之甚少。

在動(dòng)物基因組中，被稱為增強(qiáng)子（enhancer）的調(diào)控性 DNA 元件控制著特定細(xì)胞類型中基因表達(dá)的精確時(shí)空模式。然而，增強(qiáng)子在細(xì)胞核內(nèi)的空間組織以調(diào)控靶基因的方式，目前仍知之甚少。

2025 年 7 月 2 日，北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）/昌平實(shí)驗(yàn)室謝曉亮院士團(tuán)隊(duì)在 Nature Genetics 期刊發(fā)表了題為：Single-cell Micro-C profiles 3D genome structures at high resolution and characterizes multi-enhancer hubs 的研究論文。

研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了單細(xì)胞 Micro-C（scMicro-C）技術(shù)，這種是基于微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）的 3D 基因組圖譜技術(shù)，能夠以高分辨率描繪 3D 基因組結(jié)構(gòu)，并表征了多增強(qiáng)子中心（multi-enhancer hub），即多個(gè)增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子相關(guān)聯(lián)，形成空間簇。

2025 年 7 月 2 日，北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）/昌平實(shí)驗(yàn)室謝曉亮院士團(tuán)隊(duì)在 Nature Genetics 期刊發(fā)表了題為：Single-cell Micro-C profiles 3D genome structures at high resolution and characterizes multi-enhancer hubs 的研究論文。

在這項(xiàng)最新研究中，研究團(tuán)隊(duì)報(bào)道了單細(xì)胞 Micro-C（scMicro-C）技術(shù)。這是一種基于微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）的 3D 基因組圖譜技術(shù)，其空間分辨率提升至 5 kb。

這是一種基于微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）的 3D 基因組圖譜技術(shù)，其空間分辨率提升至 5 kb。

利用該技術(shù)，研究團(tuán)隊(duì)鑒定出一種特殊的 3D 增強(qiáng)子結(jié)構(gòu)--啟動(dòng)子-增強(qiáng)子條紋（promoter-enhancer stripe，PES），這種結(jié)構(gòu)能夠?qū)⒒虻膯?dòng)子與多個(gè)增強(qiáng)子連接起來(lái)。PES 是由黏連蛋白介導(dǎo)的環(huán)擠壓（loop extrusion）作用形成的，這有可能將多個(gè)增強(qiáng)子帶到啟動(dòng)子處。

此外，該研究還觀察到，在單細(xì)胞 3D 基因組結(jié)構(gòu)中，具有 PES 的基因普遍存在多增強(qiáng)子中心（multi-enhancer hub），其中多個(gè)增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子相關(guān)聯(lián)，形成空間簇。

在單細(xì)胞 3D 基因組結(jié)構(gòu)中，具有 PES 的基因普遍存在多增強(qiáng)子中心（multi-enhancer hub），其中多個(gè)增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子相關(guān)聯(lián)，形成空間簇。