自1958年分子生物學“中心法則”被提出以來,各種RNA類型被陸續(xù)發(fā)現(xiàn)。信使RNA(mRNA)將遺傳指令從DNA傳遞到蛋白質的合成,這一過程持家非編碼RNA 促進,例如小核RNA(snRNA)、核糖體RNA(rRNA)和轉運RNA(tRNA)。
在過去的四十年中,一系列具有調節(jié)基因表達功能的非編碼RNA(ncRNA)已經成為基因調控的關鍵角色。小RNA(small RNA)和長非編碼RNA(lncRNA)是目前研究最廣泛的調節(jié)性非編碼RNA,它們深刻地影響了RNA生物學領域和其他領域。雖然小RNA的作用機制已經很明確,而lncRNA表現(xiàn)出更多樣化的機制,其中許多仍然未知。
為了慶祝 Cell 創(chuàng)辦50周年,2024年11月14日,中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心(生物化學與細胞生物學研究所)陳玲玲研究員與韓國首爾大學V. Narry Kim教授受邀在 Cell 期刊發(fā)表了題為:Small and long noncoding RNAs: Past, present, and future 的長篇綜述。
該綜述系統(tǒng)性地回顧了小非編碼RNA與長非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)歷程、作用機制研究進展和生理病理學功能認知,并展望了非編碼RNA領域研究的未來方向。
除了經典的蛋白質編碼mRNA和持家非編碼RNA(例如小核RNA、核糖體RNA、轉運RNA)之外,體內還包含了眾多具有調節(jié)基因表達功能的非(蛋白)編碼RNA。這些調節(jié)性非編碼RNA根據長度不同被劃分為小非編碼RNA和長非編碼RNA。
隨著研究技術的進步與研究手段的革新,人們對于這些調節(jié)性非編碼RNA分子的認知逐漸深入,雖然對小非編碼RNA(例如microRNA等)的功能與作用機制相對清晰,但是對長非編碼RNA(lncRNA)作用機理的理解比較有限,目前仍存在大量的未解之謎。
在該綜述中,陳玲玲研究員與V. Narry Kim教授從發(fā)現(xiàn)歷程、進化保守性特點、生物合成與化學修飾機理、在體功能機制和生理病理學意義等多個維度系統(tǒng)總結了近40年來小非編碼RNA和長非編碼RNA領域的研究進展,詳細論述了非編碼RNA在調控基因表達過程中的異同、協(xié)同互作以及生理病理功能。她們指出RNA深度測序、RNA成像、基因編輯介導的RNA功能研究、RNA化學生物學等多方向的技術革新與學科的交叉融合發(fā)展,對于解釋非編碼RNA的分子機制與功能作用具有巨大推動作用。
此外,該綜述還闡述了小非編碼RNA基礎研究與應用的發(fā)展歷程,并指出相關長非編碼RNA的研究可以借鑒小非編碼RNA研究的經驗。同時,該綜述展望了非編碼RNA領域未來的研究方向,包括挖掘非編碼RNA新種類、新修飾,理解它們的折疊、加工與代謝的機理,深入揭示相關生理病理學意義,解析RNA與微環(huán)境的交互機制,以及發(fā)展交叉手段研究大片段RNA及其與互作蛋白質的結構,包括人工智能的應用等。最后,該綜述還指出非編碼RNA技術在未來臨床疾病診療中具有應用前景。
小RNA和lncRNA的關鍵發(fā)現(xiàn)
小RNA和lncRNA的進化特征和保守性
小RNA和lncRNA的生物發(fā)生
miRNA生物發(fā)生和作用的分子基礎
代表性的lncRNA的作用模式
小RNA和lncRNA之間的串擾
ncRNA的病理生理作用
原文鏈接:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01206-6
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