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在COVID-19疫情背景下,mRNA疫苗的快速崛起讓RNA療法成為全球關(guān)注的焦點(diǎn)。基于RNA的疫苗創(chuàng )下了歷史上最快疫苗研發(fā)時(shí)間的記錄,從開(kāi)發(fā)到獲FDA上市僅僅用時(shí)一年時(shí)間。發(fā)現了核苷堿基修飾的科學(xué)家更是憑此獲得了2023年諾貝爾獎。
然而,mRNA疫苗在持久性和免疫原性等方面展現出的局限性,促使科學(xué)界積極尋求新的突破。正是這樣的背景下,被譽(yù)為“mRNA 2.0”的環(huán)狀RNA(circRNA)以其獨特的優(yōu)勢被關(guān)注到。先進(jìn)國際期刊Nature發(fā)文稱(chēng)“circRNA是RNA療法的下一代重磅技術(shù)”。
前世今生——circRNA的發(fā)現
1976年,circRNA首次被發(fā)現,但當時(shí)被認為是細胞內mRNA剪接錯誤帶來(lái)的副產(chǎn)物。2013年,Nature期刊同期發(fā)表了兩篇研究論文,確立了circRNA是一類(lèi)具有調控作用的非編碼RNA,可以通過(guò)作為miRNA的海綿來(lái)調控其他基因表達。這讓沉寂30多年的circRNA一鳴驚人,并陸續被發(fā)現在細胞分化、組織穩態(tài)、疾病發(fā)展,以及免疫代謝中發(fā)揮重要調節作用。
2018年7月,是circRNA發(fā)展史上的一個(gè)關(guān)鍵轉折點(diǎn),麻省理工學(xué)院(MIT)的 Daniel Anderson 等人在 Nature Communications 期刊發(fā)表論文,首次證實(shí)工程化的circRNA可在真核細胞中穩定、高效表達蛋白,開(kāi)創(chuàng )了外源circRNA在真核細胞中表達蛋白的新應用,也證明了circRNA是線(xiàn)性mRNA的有效替代品。
▲ circRNA研究的里程碑事件
異軍突起——circRNA vs mRNA
線(xiàn)性mRNA疫苗雖然研發(fā)周期短且易于實(shí)現量產(chǎn),但在RNA技術(shù)中有一個(gè)關(guān)鍵的缺陷,即其通常以線(xiàn)性形式存在,而這種形式存在的mRNA壽命很短。一般來(lái)說(shuō),在幾個(gè)小時(shí)之內,細胞內的核酸酶就會(huì )將其降解掉。對于mRNA疫苗而言,其短暫的壽命并非什么大問(wèn)題,因為RNA只需要很短的時(shí)間就能編碼出蛋白質(zhì),從而引起免疫反應。
而對于大多數治療來(lái)說(shuō),則需要讓RNA停留足夠長(cháng)的時(shí)間才能具有更長(cháng)的療效。這時(shí)候就需要在合成時(shí)對其進(jìn)行大量修飾,以抵抗細胞內核酸酶的降解及避免引起先天免疫刺激,然后再通過(guò)脂質(zhì)納米顆粒(LNP)遞送。整個(gè)過(guò)程效率低下,且價(jià)格昂貴。即便如此,修飾后的線(xiàn)性mRNA的半衰期還是較短。
不同于線(xiàn)性mRNA,circRNA是一種獨特的單鏈RNA分子,其最顯著(zhù)的特點(diǎn)在于其共價(jià)閉合的連續環(huán)形結構,原本在線(xiàn)性RNA分子中存在的3'和5'末端被巧妙地連接在一起,這與傳統線(xiàn)性RNA截然不同。這一獨特的環(huán)形結構賦予了circRNA諸多優(yōu)勢,不僅使其能夠有效抵御核酸酶的降解,還顯著(zhù)提升了蛋白表達效率。同時(shí),未修飾的circRNA具有較小的副作用,安全性能更高,且可以延長(cháng)抗原遞呈時(shí)間并保持長(cháng)久的免疫反應,即使在低劑量水平,也可以增加其治病潛力,從而制造成本也大大降低。
▲ circRNA的形成
遞送策略上,circRNA的遞送通常采用LNP、外泌體和病毒樣顆粒。總體而言,目前circRNA的遞送仍然廣泛采用LNP系統。但LNP也存在一些不容忽視的缺點(diǎn),比如具有肝臟積累的傾向,肝外應用受限等。外泌體和病毒樣顆粒則具有更強的生物兼容性。
(關(guān)于外泌體如何賦能下一代CGT藥物開(kāi)發(fā),亦諾微創(chuàng )始人兼CEO周?chē)┦繉⒂?024 年 9 月 4 日,在艾本德聯(lián)合醫麥客、ATLATL飛鏢創(chuàng )新研發(fā)中心舉辦的以“逐本未來(lái),品質(zhì)為先”為主題的沙龍活動(dòng)--新一代 CGT 藥物創(chuàng )享交流會(huì )上分享。歡迎掃碼報名線(xiàn)上或線(xiàn)下參加。)
mRNA 2.0未來(lái)可期
1.潛在應用前景及挑戰
circRNA作為下一代RNA療法的核心,有望治療各種難治性疾病,包括病毒性傳染病、腫瘤、病原菌感染、自身免疫性疾病、代謝性疾病等。
▲ circRNA的潛在應用
蛋白質(zhì)替代療法:其目的是恢復那些缺失或有缺陷的蛋白質(zhì)功能,通常是由基因突變導致。采用mRNA治療內源蛋白缺失已應用于多種疾病。相對于mRNA,circRNA結構具有更高的穩定性,蛋白質(zhì)表達時(shí)間更長(cháng),從而可以產(chǎn)生較高的蛋白質(zhì)累積并持續較長(cháng)時(shí)間,減少給藥頻率,且免疫原性較低。
杜氏肌營(yíng)養不良癥(DMD),是由于 X 染色體上編碼抗肌萎縮蛋白的基因突變所導致的遺傳病,患者無(wú)法產(chǎn)生足夠的抗肌萎縮蛋白。Orna Therapeutics公司發(fā)現了使用circRNA-LNP進(jìn)行DMD的治療,可以實(shí)現持久高效的蛋白表達,甚至是長(cháng)編碼區蛋白的表達,且編碼全長(cháng)抗肌萎縮蛋白和截短體的circRNA均能在原代骨骼肌細胞中表達。
疫苗:疫苗接種的目標是誘導強烈的適應性免疫反應和長(cháng)期免疫記憶。適應性免疫記憶的誘導部分取決于抗原暴露的持續時(shí)間。與mRNA相比,circRNA固有的穩定性延長(cháng)了蛋白質(zhì)翻譯的時(shí)間,增加了體內的蛋白質(zhì)產(chǎn)量,長(cháng)期表達抗原可以更有效地誘導具有持久免疫記憶的免疫反應。
近日,復旦大學(xué)基礎醫學(xué)院璩良等人發(fā)表了一篇文章,詳細解析了通過(guò)注射編碼HER2特異性腫瘤抗原的circRNA疫苗增強circRNA-CAR介導的巨噬細胞和T淋巴細胞的抗腫瘤效應。
癌癥免疫療法:采用機體免疫的作用成分如細胞因子、抗體和免疫細胞等進(jìn)行癌癥的治療。circRNA在癌癥免疫治療領(lǐng)域展現出多重優(yōu)勢,包括其可用于腫瘤個(gè)性化治療、高穩定性確保抗原蛋白的穩定表達,以及誘導更強的免疫反應。同時(shí),circRNA固有的較低免疫原性對于腫瘤內免疫刺激蛋白表達更具優(yōu)勢。
細胞因子作為一類(lèi)小型蛋白信號分子,已被證實(shí)具有增強抗腫瘤效果的能力。其中,白細胞介素-12(IL-12),作為細胞介導免疫的有效誘導劑,具有刺激活化 T 細胞和 NKT 細胞的效應功能,在肺癌等實(shí)體瘤中顯示出良好的抗腫瘤作用。但由于它的脫靶毒性和給藥方式的低效性,其應用受到限制。近日,多倫多大學(xué)李博文團隊篩選出針對肺癌的H1L1A1B3 可電離脂質(zhì),將其整合進(jìn)脂質(zhì)納米顆粒(LNPs)。然后利用這些納米顆粒包封核酸,但包封的是 IL-12 circRNA,而不是IL-12 mRNA。將IL-12 circRNA 有效遞送到肺部腫瘤,并聯(lián)合免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療(ICI),最終提高了肺癌免疫治療的效果。
基因編輯:與mRNA相比,circRNA提供的穩定性和穩健表達可以使Cas9蛋白的持久性更長(cháng),增加的蛋白表達可能會(huì )顯著(zhù)提高基因編輯效率。
在A(yíng)DARs介導的RNA編輯中,2022年,魏文勝課題組設計并運用了可招募ADAR的環(huán)形RNA(circ-arRNA),通過(guò)AAV遞送,遺傳編碼的circ-arRNA可以在人的原代細胞和類(lèi)器官中實(shí)現長(cháng)時(shí)程的RNA編輯,這種可避免核酸外切酶切割的環(huán)狀RNA進(jìn)一步提升了體外和體內編輯的效率和精準性, 基本清除了雙鏈RNA區域內目標轉錄本上的脫靶。
非編碼環(huán)狀RNA治療:circRNA在細胞內具有內源性非編碼功能,如miRNA和RNA結合蛋白海綿功能。circRNA作為調控RNA,具有作為miRNA和RNA結合蛋白的競爭性抑制劑從而進(jìn)行治療的潛力。
總的來(lái)說(shuō),circRNA 的潛力和市場(chǎng)的熱情預示著(zhù)其光明的前景,但其仍存在一些挑戰。比如如何精準調控circRNA的表達水平,使其維持在適當的功能水平而不會(huì )過(guò)量表達導致毒性,還需要進(jìn)一步開(kāi)發(fā);對 circRNA 修飾需要進(jìn)行更深入的研究來(lái)進(jìn)一步降低circRNA的免疫原性。同時(shí),遞送也是各應用的主要挑戰之一。相信隨著(zhù)科研技術(shù)的不斷進(jìn)步,circRNA技術(shù)的持續改進(jìn)有助于其更廣泛的進(jìn)入產(chǎn)業(yè)化階段。
2.全球產(chǎn)業(yè)化布局
放眼全球,盡管這個(gè)賽道吸引了國內外企業(yè)紛紛布局,然而目前還未有真正的circRNA藥物上市,所有在研管線(xiàn)都處于臨床階段,已入局的玩家幾乎都是剛起步創(chuàng )業(yè)的生物醫藥公司。
同樣,這個(gè)風(fēng)口也被MNC盯上,布局該領(lǐng)域的新銳公司都從融資市場(chǎng)攬獲了不小的支持。業(yè)內人士戲稱(chēng),2021年堪稱(chēng)circRNA相關(guān)企業(yè)的融資元年。
Orna Therapeutics是全球首家利用circRNA技術(shù)開(kāi)發(fā)新療法的公司,主要項目是一種原位CAR療法,它結合了circRNA分子和LNP技術(shù),將CAR直接遞送至患者體內的免疫細胞。據Orna Therapeutics官網(wǎng)所示,其主攻方向是利用circRNA的穩定性制備原位CAR-T。
另外,值得一提的是,Orna Therapeutics在人類(lèi)細胞中實(shí)現了全長(cháng)抗肌萎縮蛋白編碼RNA的非病毒遞送,以及在小鼠模型中實(shí)現了較小長(cháng)度抗肌萎縮蛋白編碼RNA的體內遞送。
Orna Therapeutics成立于2019年,成立之初便獲得了1000萬(wàn)美元種子輪資金,2021年完成了1億美元的融資,截至2022年完成了2.21億美元的B輪融資,并與默沙東達成了一項總資金為36.5億美元的合作。
著(zhù)名風(fēng)投機構Flagship于2021年投資5000萬(wàn)美元創(chuàng )立了Laronde。Laronde同樣布局circRNA賽道,其核心技術(shù)是自主研發(fā)的eRNA環(huán)化技術(shù)。成立僅3個(gè)月,Laronde就獲得了4.4億美元的B輪融資,是迄今為止circRNA公司獲得的最大的一筆融資。
2023年,Laronde宣布和Flagship孵化的一家納米載體Senda Biosciences合并成為一家新公司——Sail Biomedicines,將Laronde的環(huán)狀RNA平臺和Senda的可編程納米顆粒平臺結合起來(lái),開(kāi)啟全面可編程的藥物開(kāi)發(fā)。
不僅是國際上布局circRNA的企業(yè)在瘋狂吸金,國內不少企業(yè)也獲得了大筆融資。以圓因生物為代表的circRNA新銳企業(yè),與國際企業(yè)齊頭并進(jìn),紛紛打造了各自的技術(shù)平臺。
圓因生物是國內首家布局circRNA的企業(yè),建立了體外高效制備高純度circRNA的技術(shù)平臺,針對新冠病毒及其變異株,設計了編碼新冠病毒刺突蛋白RBD的circRNA疫苗。2021年和2022年,圓因生物分別完成了超億元的Pre-A輪融資和2.8億元人民幣的A輪融資。
除此之外,2021年成立的環(huán)碼生物也受到了資本的青睞,成為國內首家circRNA融資企業(yè)。截至目前,環(huán)碼生物已經(jīng)完成了A輪融資,預估累計融資金額近4千萬(wàn)美元。
環(huán)碼生物擁有多項自主研發(fā)專(zhuān)利,如基于II型內含子自剪接核酶的活性可在體外環(huán)化任意RNA,其還建立了一套基于circRNA的高通量篩選系統可以高效篩選翻譯起始元件,并為circRNA建立了基于人工智能的序列優(yōu)化設計平臺。
據悉,環(huán)碼生物曾接連兩度與MNC攜手。2023年7月,環(huán)碼生物與輝瑞就circRNA療法達成研發(fā)合作協(xié)議。今年2月,環(huán)碼生物宣布與BMS達成一項可行性研究合作。
此外,國內企業(yè)先博生物和國外circRNA領(lǐng)頭羊Orna Therapeutics還達成了合作。除了上述幾家企業(yè)之外,其他代表性的企業(yè)還有科銳邁德、博雅輯因、吉賽生物、博安生物等也已經(jīng)形成了具有獨特優(yōu)勢的技術(shù)平臺。
在此背景之下,還有部分企業(yè)著(zhù)眼于解決痛點(diǎn)、難點(diǎn)問(wèn)題的核心專(zhuān)利技術(shù)上,如日前,艾博生物公布其自主研發(fā)的、擁有全球自主知識產(chǎn)權的高效RNA成環(huán)順式剪接系統(Cis系統),突破了海外PIE系統專(zhuān)利的限制,有望成為高效制備高質(zhì)量circRNA的突破性技術(shù)。放眼未來(lái),本土創(chuàng )新想要避免發(fā)生“mRNA專(zhuān)利戰”的前車(chē)之鑒,只有提早突破海外壁壘,才能有望在circRNA技術(shù)得到大規模應用之前,迅速搶占其帶來(lái)的無(wú)限潛力和廣闊的全球市場(chǎng)機遇。
總結
整體來(lái)說(shuō),circRNA賽道活力迸發(fā),雖然整體尚處于早期階段,但東風(fēng)已至,天下已成大爭之勢。隨著(zhù)國內外企業(yè)持續深化circRNA布局,加速釋放其潛力,以及技術(shù)的不斷成熟,這種更穩定、低成本的新一代RNA療法——circRNA,有望迅速崛起,站在mRNA這一“巨人”的肩膀上,成為下一個(gè)熱門(mén)賽道。
參考資料:
1.各企業(yè)官網(wǎng)
2.https://mp.weixin.qq.com/s/_Oxyw8dDYDg2n4Gd_NhFiQ
3.https://mp.weixin.qq.com/s/O04zscDDROencxupwUkO2Q
4.https://mp.weixin.qq.com/s/Y_oqFYTRMdFkc0aHFUB8Hw
5.https://mp.weixin.qq.com/s/ZlgVrECiWNR9kijgF5fFbA
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