KRAS是癌癥中最常見(jiàn)的基因突變之一,大約有三分之一的癌癥攜帶KRAS突變。然而,由于該靶點(diǎn)表面平滑且缺乏理想的小分子結合位點(diǎn),長(cháng)期以來(lái)它一直被視為“不可成藥”的靶點(diǎn)。
這一切在全球首 個(gè)KRAS抑制劑Sotorasib(AMG 510)獲得批準上市后發(fā)生了歷史性的突破。但近期,其治療效果遭到美國食品藥品監督管理局(FDA)腫瘤藥物咨詢(xún)委員會(huì )(ODAC)的質(zhì)疑。ODAC提出,該藥物的主要研究終點(diǎn)——盲態(tài)獨立中心評估的無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)數據難以令人信服。
同時(shí),Adagrasib(MRTX849)作為第二款全球上市的KRAS G12C抑制劑,歐洲藥品管理局(EMA)曾拒絕批準 adagrasib上市,原因是:缺乏具有有效性的全面數據。不過(guò)今年1月,歐盟最終還是附條件批準了adagrasib上市。
面對未來(lái)布滿(mǎn)未知和挑戰的道路,KRAS抑制劑的命運仍懸而未決。在近幾年AACR會(huì )議上,有關(guān)KRAS的最新研究將嘗試突破這一僵局。本文將深入探討這些激動(dòng)人心的科學(xué)進(jìn)展。
從0到1:
KRAS G12C共價(jià)抑制劑簡(jiǎn)史
上世紀80年代以前,人們對癌癥的成因知之甚少,唯一清楚的是某些病毒可引發(fā)癌癥。
1982年,科學(xué)家從人類(lèi)細胞系中獨立分離出第一批致癌基因序列,其中就包括KRAS基因。
繼這一發(fā)現之后,科學(xué)家們開(kāi)始研究這些癌基因的功能。發(fā)現正常情況下RAS蛋白是通過(guò)與能量分子GDP/GTP的結合與解離調節其活性。但是,KRAS突變會(huì )使得RAS蛋白無(wú)法解離并永 久活化,從而持續激活下游信號通路,刺激細胞生長(cháng)。
許多科學(xué)家花費了三十年的時(shí)間試圖攻克它,卻都以失敗告終。KRAS 之所以難以被藥物鎖定,主要是因為它表面光滑,缺少能夠讓抑制劑穩定結合的“溝壑”。
好在科學(xué)家們發(fā)現了一種特殊的 KRAS 突變G12C 突變(第12位甘氨酸Glycine突變?yōu)榘腚装彼酑ystine),為藥物開(kāi)發(fā)帶來(lái)了新機遇。這種突變會(huì )在蛋白表面形成一個(gè)可結合小分子共價(jià)抑制劑的半胱氨酸位點(diǎn)。
據統計,大約有 13% 的非小細胞肺癌和 3% 的結直腸癌患者有 KRAS 突變,其中約一半是 G12C 突變。可見(jiàn),只要能搞定 KRAS G12C,就有望取得重大的治療進(jìn)展。
圖1 KRAS藥物開(kāi)發(fā)里程碑
圖片來(lái)源:參考資料1
臨床前研究證實(shí),靶向KRAS G12C突變位點(diǎn)的小分子抑制劑能夠抑制KRAS下游信號傳導。基于此,多家制藥公司開(kāi)發(fā)出一系列KRAS G12C抑制劑進(jìn)入臨床試驗,并取得突破性進(jìn)展。
AMG 510(sotorasib)是首 個(gè)進(jìn)入臨床的KRAS G12C抑制劑。I期臨床試驗數據顯示,該藥物可使部分KRAS G12C突變的肺癌腫瘤縮小。
MRTX849(adagrasib)是另一KRAS G12C小分子抑制劑,I期臨床試驗中也觀(guān)察到部分肺癌和結直腸癌患者獲得局部緩解。除了單藥療效外,將MRTX849與其他治療方式聯(lián)合,如免疫檢查點(diǎn)抑制劑、靶向受體酪氨酸激酶、mTOR或細胞周期分子等,在多種腫瘤模型中顯示出增強的抗癌活性,特別是在單藥難以治療的腫瘤中。
雖然靶向KRAS(OFF)狀態(tài)的 AMG 510和MRTX849為癌癥治療開(kāi)辟了新的途徑,但面臨的主要問(wèn)題是多種復雜的耐藥機制。近幾年AACR大會(huì )陸續報道了國內外數個(gè)新一代KRAS廣譜抑制劑和靶向KRAS G12D的小分子有望突破已上市的KRAS抑制劑的局限性。
KRAS G12D(ON)抑制劑:
鎖定 KRAS蛋白“上膛”狀態(tài)
以Revolution Medicines公司在研項目RMC-9805為例,它通過(guò)抑制處于“開(kāi)啟”狀態(tài)的 KRAS 蛋白發(fā)揮作用。
Revolution 研究人員提供的數據顯示,作為單一療法,該藥物可以抑制胰腺導管腺癌 (PDAC) 和非小細胞肺癌 (NSCLC) 動(dòng)物模型中的腫瘤生長(cháng)。RMC-9805目前正在進(jìn)行一項涉及 NSCLC、PDAC、結直腸癌或其他實(shí)體瘤患者的 1 期臨床研究。
Verastem公司的海報顯示,該公司與合作伙伴勁方醫藥(GenFleet Therapeutics) 正在開(kāi)發(fā)一種名為GFH375/VS-7375的口服 KRAS G12D (ON/OFF)抑制劑,可有效對抗小鼠的胰腺癌和結直腸癌。該藥物通過(guò)獨特機制作用于活化/失活狀態(tài)的KRAS G12D突變蛋白,選擇性抑制KRAS G12D突變腫瘤細胞內的KRAS通路信號傳遞和細胞增殖。
除了G12D之外,Quanta Therapeutics還展示了一張海報,其中的數據顯示,其針對 KRAS G12V 的口服藥物 QTX3544 可抑制胃癌、胰腺癌、肺癌和卵巢癌小鼠模型中的腫瘤生長(cháng)。
Frontier Medicines的KRAS G12C 抑制劑 FMC-376,新數據顯示,其減小了 NSCLC 和結直腸癌小鼠模型中的腫瘤大小。將 FMC-376 與 PD-1 抑制劑聯(lián)合使用還可增強 PD-1 抑制劑在小鼠肺癌模型中的療效。與 Verastem的GFH375/VS-7375 一樣,Frontier的FMC-376 在“開(kāi)啟”和“關(guān)閉”狀態(tài)下均作用于 KRAS,但突變不同。FDA 批準的兩種 KRAS G12C 抑制劑,Amgen 的 AMG510和 Mirati Therapeutics 的 MRTX849,僅在“關(guān)閉”狀態(tài)下對該分子起作用。
圖2 KRAS 信號通路示意圖。如圖所示除了針對 G12C 突變,科學(xué)家們還發(fā)現了一種“三聯(lián)抑制劑”,可以與上膛裝彈的 KRAS 蛋白結合,這就好比卡住了 KRAS 這把槍的扳 機,阻止它發(fā)射致癌信號。此外,還有一種 SOS1 抑制劑,能夠切斷 KRAS 獲取“子 彈”的能力,從而從根本上遏制 KRAS 蛋白的活性。
圖片來(lái)源:AACR官網(wǎng)博客
最后,關(guān)注一下Bridgebio公司的另一款針對 KRAS(on)狀態(tài)的抑制劑BBO-8520,這款藥物并不是第一次出現在A(yíng)ACR舞臺,前幾年它就報道過(guò)自己與其他已知的KRAS G12C抑制劑不同,因為它能夠在KRAS G12C的GTP結合(ON)和GDP結合(OFF)兩種狀態(tài)下都與其結合。這種特性使得BBO-8520在抑制KRASG12C的活性方面表現出更強的效力。
按資料介紹BBO-8520通過(guò)與Switch II口袋共價(jià)結合,鎖定了GTP結合的KRAS G12C在狀態(tài)1的構象中,這個(gè)構象無(wú)法與效應蛋白結合,從而快速且完全阻斷了效應蛋白的結合。這種直接作用于KRAS G12C(ON)的能力導致在效應蛋白(Raf1)結合測定中表現出強大的抑制作用(約30納摩爾),而其他僅作用于(OFF)狀態(tài)的抑制劑在這一測定中沒(méi)有表現出可測量的效力。相比之下,已上市的兩款共價(jià)抑制劑藥物如sotorasib和adagrasib通常只能與KRASG12C的GDP結合(OFF)狀態(tài)形成結合,因此在抗藥性出現時(shí),它們的效果可能會(huì )減弱。BBO-8520的設計旨在通過(guò)同時(shí)抑制(ON)和(OFF)狀態(tài)來(lái)提供更全面的靶點(diǎn)覆蓋,并解決對當前(OFF)狀態(tài)抑制劑的適應性抵抗機制。
圖3 BBO-8520與傳統KRAS抑制劑不同的作用機制。
圖片來(lái)源:AACR會(huì )議截圖
但需要注意的是KRAS藥物往往單藥的臨床效果并不理想,很多臨床試驗都是聯(lián)合給藥。
比如同時(shí)靶向KRAS和SHP2或者KRAS和PI3K。因為如果只針對KRAS,癌細胞可能會(huì )通過(guò)激活PI3K通路來(lái)繞過(guò)這一阻斷。但如果同時(shí)使用針對PI3K的藥物,這種逃避機制就會(huì )被削弱,從而增加治療成功的機會(huì )。
不過(guò)PI3k激酶靶點(diǎn)毒副作用大,很考驗小分子的選擇性。BBO-10203就選擇了別構抑制劑的思路打斷PI3K和RAS的相互作用從而達到降低毒副作用的目的,不過(guò)究竟療效如何還是要看臨床的結果。
目前在肺癌PDX模型上和AMG510的對比結果如下,BBO-8520的確潛力不錯:
圖4 BBO-8520和AMG510的腫瘤抑制效果對比。
圖片來(lái)源:參考資料3
下圖筆者比較了三款在研不同機理的KRAS抑制劑的結構:
MRTX1133是KRAS G12D 的高選擇性抑制劑,可逆性地與活化和失活的 KRAS G12D 突變體結合并抑制其活性。據報道,MRTX1133 對 KRAS G12D 的特異性是野生型 KRAS 的 1000 倍以上。
益方生物的D-1553是一種口服 KRAS G12C 抑制劑。它有望治療 KRAS G12C 突變的非小細胞肺癌(NSCLC)。
BBO-8520 則可在 KRAS G12C 的 GTP 結合態(tài)(ON)和 GDP 結合態(tài)(OFF)構象中與開(kāi)關(guān) II 口袋共價(jià)結合,從而快速、強效地抑制 KRASG12C 的活性。
圖5 KRAS在研抑制劑MRTX1133和D1553以及BBO-8520的結構比較
圖片來(lái)源:作者自制
未來(lái)的挑戰與希望
在醫藥江湖中,KRAS致癌基因如同指環(huán)王中的索隆惡魔,其變幻莫測的致癌手段讓無(wú)數英雄束手無(wú)策。KRAS巧妙利用癌細胞的突變異常狡猾多變,發(fā)展出各種耐藥機制,讓眾多靶向藥失去了效力。
幸運的是,隨著(zhù)KRAS靶向治療的新思路,比如廣譜KRAS以及新一代非共價(jià)抑制劑,如同江湖傳來(lái)的一陣春風(fēng),帶來(lái)了克服現有藥物耐藥性的新希望。獵藥人通過(guò)不懈的努力,終于讓這些新療法步入了臨床試驗的階段,預示著(zhù)未來(lái)可能大放異彩,為蒼生帶去福音。
文章最后推薦兩篇文獻,KRAS廣譜非共價(jià)抑制劑去年5月刊登在《自然》的論文:PAN-KRAS抑制劑抑制致癌信號和腫瘤生長(cháng)。
圖6 Pan-KRAS非共價(jià)抑制劑結合WT、G12C、G12D、G12V和G13D突變KRAS的共晶結構及活性數據。
圖片來(lái)源:參考資料5
另一篇發(fā)表在自然子刊的川大華西聯(lián)合成都中醫大發(fā)布靶向“不可成藥”蛋白質(zhì)的最新進(jìn)展,包括KRAS等多個(gè)難以成藥靶點(diǎn)的共價(jià)抑制劑,變構抑制劑以及蛋白質(zhì)相互作用抑制劑的開(kāi)發(fā)進(jìn)展,詳細總結了正在臨床階段的共價(jià)抑制劑結構及相關(guān)機制,為廣大研究者提供了寶貴的知識和啟示。也期待這些新藥早日通過(guò)三期臨床,造福廣大癌癥患者。
圖7包括KRAS,EGFR和p53多個(gè)癌癥相關(guān)難以成藥靶點(diǎn)的共價(jià)抑制劑開(kāi)發(fā)綜述。
圖片來(lái)源:參考資料5
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