近年來(lái)，人工智能技術(shù)的快速發(fā)展，為生命科學(xué)領(lǐng)域帶來(lái)了新的可能性。深勢科技也在不斷探索AI為藥物設計帶來(lái)的變革。5月27日，深勢科技Hermite®夏季發(fā)布會(huì )在蘇州圓滿(mǎn)落幕。Hermite®致力于為藥物研發(fā)工作者提供數據、算法、算力三位一體的一站式解決方案，通過(guò)提供有價(jià)值的計算設計工具，成為藥物研發(fā)工作者的“手”、“眼”、“腦”。現場(chǎng)，眾多業(yè)內重要專(zhuān)家和代表性企業(yè)齊聚，見(jiàn)證深勢科技新算法成果及新一代藥物計算設計平臺Hermite®新功能的發(fā)布。同時(shí)，關(guān)于抗體、RNA及合成生物學(xué)三大熱門(mén)領(lǐng)域的前沿思想，也在這里交匯、碰撞出新的火花。
會(huì )上，中國科學(xué)院院士、北京科學(xué)智能研究院院長(cháng)鄂維南首先進(jìn)行開(kāi)場(chǎng)致辭。鄂維南表示：當前人工智能技術(shù)的應用已經(jīng)成功的滲透到了各個(gè)領(lǐng)域。AI for Science作為引領(lǐng)當下科學(xué)技術(shù)革命的重要驅動(dòng)力，正在為合成生物學(xué)以及抗體和RNA研究等在內的眾多領(lǐng)域帶來(lái)新的解決方案。開(kāi)展這一類(lèi)的研究，離不開(kāi)分子模擬實(shí)驗預測理論創(chuàng )新等等，這也是人工智能帶來(lái)的新的機會(huì )所在。
鄂維南指出：AI for Science已經(jīng)進(jìn)入了預訓練模型時(shí)代，這使得利用大數據和算法的力量對生物大分子進(jìn)行深度挖掘變得更加可行和高效。通過(guò)構建生物網(wǎng)模型能夠為分析生物大分子之間的相互作用、研究RNA的調控等等提供更加有力的支持。AI for Science的底層算法對于優(yōu)化藥物設計、預測藥物的作用，降低藥物研發(fā)成本具有很大的幫助，這也是深勢科技在不斷突破的重點(diǎn)方向之一。今天發(fā)布的 Hermite®生物大分子解決方案就是深勢科技基于[多尺度建模+機器學(xué)習+高性能計算]等科學(xué)研究的新范式在微觀(guān)工業(yè)設計領(lǐng)域推出的新產(chǎn)品。人工智能的技術(shù)發(fā)展已經(jīng)逐步成熟，不過(guò) AI 能為生命科學(xué)和生物醫學(xué)做的遠遠不止于此。AI 技術(shù)在大分子相關(guān)研究中的應用還在不斷完善。AI 模型的準確性和可靠性以及可解釋性還需要進(jìn)一步的提高，AI 技術(shù)和實(shí)驗驗證相結合將為藥物研發(fā)持續提供更為可靠的依據。
隨后，深勢科技創(chuàng )始人兼CEO孫偉杰介紹了深勢科技基于A(yíng)I for Science的新算法。
孫偉杰首先簡(jiǎn)單介紹了預訓練模型的原理和應用。在大分子研發(fā)中，序列、結構、動(dòng)力學(xué)這三類(lèi)預訓練模型都有非常大的開(kāi)發(fā)空間。他陸續介紹了深勢科技基于序列的結構和動(dòng)力學(xué)預測、基于序列的蛋白性質(zhì)預測、基于結構和動(dòng)力學(xué)的蛋白性質(zhì)預測，以及RNA結構預測等深勢自研的多個(gè)性質(zhì)預測模型，效果遠超此前算法。孫偉杰表示，得益于包括DPA、Uni-Mol、Uni-Fold在內的一系列AI4S預訓練模型的發(fā)展，當前我們在生物醫藥領(lǐng)域面臨的機遇，就像2018年2019年泛AI領(lǐng)域面臨的機遇一樣，AI4S已進(jìn)入預訓練模型時(shí)代。深勢科技將蓄力打造生物醫藥的GPT，為行業(yè)研發(fā)提供新起點(diǎn)。選擇Hermite®，就是選擇了強悍的組織保障，也是選擇與AI新時(shí)代接軌。
在強大算法體系的支撐下，深勢科技的產(chǎn)品也在不斷迭代、超越。Hermite®是深勢科技近年來(lái)在A(yíng)I for Science領(lǐng)域深耕和集大成的平臺產(chǎn)品，去年10月，深勢科技在上海重磅發(fā)布新一代藥物計算設計平臺Hermite®，如今，Hermite®迎來(lái)了全新升級。
基于深勢科技AI for Science新算法，公司藥物設計平臺產(chǎn)品負責人徐濤博士發(fā)布了Hermite®產(chǎn)品新功能。對于大分子研發(fā)領(lǐng)域，Hermite®新增生物大分子整體解決方案，實(shí)現了從序列分析到結構預測，結構預測到功能分析，及基于功能分析后的生物大分子設計的全流程功能。
在可視化方面，Hermite® 體驗全新升級，新增的分子展示體驗能夠幫助藥物研發(fā)科學(xué)家更好地展現、查看、構建和優(yōu)化預測結果的2D和3D結構。
在小分子藥物研發(fā)領(lǐng)域， 基于深勢科技最新算法成果，Hermite®上線(xiàn)了Uni-QSAR，一個(gè)集合預訓練模型的、多維度表征分子的、多模型自動(dòng)集成的功能。基于Uni-Mol預訓練模型，Uni-QSAR 不僅有效解決了傳統QSAR領(lǐng)域中：有標簽數據“稀缺”、分子表征能力低、手動(dòng)調參、模型單一等挑戰，其多模型集成的高效并行流程及資源調度模型，更極大降低了建模的成本，提高了建模的速度，在諸如分子性質(zhì)預測等任務(wù)的標準測試下，結果達到SOTA[1]。此外，Hermite®也進(jìn)一步優(yōu)化和豐富了其核心功能Uni-FEP，Uni-Aquasite的實(shí)際應用場(chǎng)景，提升了穩定性和準確性的同時(shí)，大幅提高平臺操作友好性和便捷性。
圍繞近期熱門(mén)領(lǐng)域，大會(huì )還開(kāi)展了生物藥創(chuàng )新論壇、RNA前沿論壇、合成生物學(xué)論壇等三場(chǎng)別開(kāi)生面的討論，十余位嘉賓進(jìn)行了深入交流、探討。在上海交通大學(xué)藥學(xué)院院長(cháng)張翱的主持下，晶泰科技聯(lián)合創(chuàng )始人&CEO馬健、火山引擎醫療健康行業(yè)解決方案總監楊旭東、沙礫生物創(chuàng )始人&首席執行官劉雅容、華為云中國區生物醫藥行業(yè)總經(jīng)理樸雪花、諾納生物CTO何云圍繞生物藥創(chuàng )新展開(kāi)了討論。圍繞RNA前沿話(huà)題，楷拓生物聯(lián)合創(chuàng )始人&CEO王瀟、礪博生物創(chuàng )始人&CEO詹劍、思合基因聯(lián)合創(chuàng )始人黨云琨、維亞生物高級副總裁蔡建華、艾博生物計算生物負責人陳榮華、竣蒞醫藥創(chuàng )始人&CEO徐軍、深勢科技大分子研發(fā)負責人溫翰進(jìn)行了深入交流。在合成生物學(xué)論壇中，芯宿科技聯(lián)合創(chuàng )始人&CSO董一名、麗合智造首席算法科學(xué)家邢華東、聚維元創(chuàng )聯(lián)合創(chuàng )始人&CTO李承、斯道資本資深投資經(jīng)理王博分享了各自觀(guān)點(diǎn)。
新藥研發(fā)長(cháng)期背負著(zhù)三座大山：高風(fēng)險、高投入、長(cháng)周期。近年來(lái)，行業(yè)痛點(diǎn)愈發(fā)顯現、尋求突破愈發(fā)困難，藥物研發(fā)工作者也亟需升級自己的“武器庫”。深勢科技基于A(yíng)I for Science新范式，創(chuàng )新成果頻出，未來(lái)也將在“持續創(chuàng )新，成就伙伴”的理念下，將Hermite®打造為新一代臨床前藥物設計綜合整體解決方案。
參考文獻
[1] Gao, Zhifeng, et al. "Uni-QSAR: an Auto-ML Tool for Molecular Property Prediction." arXiv preprint arXiv:2304.12239 (2023).
關(guān)于深勢科技
深勢科技致力于運用人工智能和分子模擬算法，結合先進(jìn)計算手段求解重要科學(xué)問(wèn)題，為人類(lèi)文明最基礎的生物醫藥、能源、材料和信息科學(xué)與工程研究打造新一代微尺度工業(yè)設計和仿真平臺。
我們開(kāi)創(chuàng )性地提出了「多尺度建模+機器學(xué)習+高性能計算」的革命性科學(xué)研究新范式，并推出了Bohrium®微尺度科學(xué)計算云平臺、Hermite®藥物計算設計平臺、RiDYMO®強化動(dòng)力學(xué)平臺及電池材料計算設計平臺等微尺度工業(yè)設計基礎設施，顛覆了現有研發(fā)模式，打造“計算引導實(shí)驗、實(shí)驗優(yōu)化設計”的全新范式。
深勢科技是國家高新技術(shù)企業(yè)、北京市“專(zhuān)精特新”中小企業(yè)，總部位于北京，并在上海、深圳等城市布局研發(fā)中心。科研技術(shù)團隊由中國科學(xué)院院士領(lǐng)銜，匯集了超百位數學(xué)、物理、化學(xué)、生物、材料、計算機等多個(gè)領(lǐng)域的優(yōu)秀青年科學(xué)家和工程師，其中公司的博士及博士后占比超過(guò)35%。核心成員獲得過(guò)2020年全球計算機高性能計算領(lǐng)域的最高獎項“戈登貝爾獎”，相關(guān)工作當選2020年中國十大科技進(jìn)展和全球AI領(lǐng)域十大技術(shù)突破。
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