趙宇發(fā)了一條朋友圈,這是他離開(kāi)微醫一年多后,首次公開(kāi)自己的“新戰場(chǎng)”:哲源科技,由中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所孵化的一家構建生命數據解析平臺的人工智能企業(yè)。
此前,趙宇在微醫曾擔任負責市場(chǎng)及戰略的副總裁,多年深耕“互聯(lián)網(wǎng)+醫療”領(lǐng)域。他認為,“醫療是人工智能最大的一個(gè)應用場(chǎng)景之一,隨著(zhù)科技的進(jìn)步,人類(lèi)在臨床上積累的數據越來(lái)越多,以基因組為代表的數據產(chǎn)生量呈指數上升,數據更新日益加快、獲取數據成本降低,當面對每個(gè)個(gè)體超百G的數據,累積數據超過(guò)PB級(1P=106G)時(shí),我們如何解讀這些多元、高維、海量、異構的信息,便成為了關(guān)鍵。”普通的小型計算機已經(jīng)無(wú)法滿(mǎn)足其分析和解讀的需求,哲源科技便通過(guò)模型、超算技術(shù)來(lái)突破解讀,認知的瓶頸。
基于此,哲源科技聯(lián)合中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所科研團隊,推動(dòng)以國家隊的身份首倡并推動(dòng)計算醫學(xué),所謂計算醫學(xué),是致力于發(fā)展定量方法,通過(guò)應用數學(xué)、工程學(xué)和計算科學(xué)來(lái)智能化理解人類(lèi)疾病的機理,并基于工業(yè)化的數據、算法、算力及生物醫學(xué)技術(shù)體系為醫學(xué)服務(wù)提供新洞見(jiàn)。
通過(guò)構建人類(lèi)的數字生命,讓數據來(lái)表達人體的治療后反應,這種設想已經(jīng)不再是腦洞大開(kāi),而是哲源科技實(shí)實(shí)在在正在踐行的項目,以計算機(超算)模擬人體內的信息交互,將生命變得可數據化,從而解讀人體的生命數據,再利用其進(jìn)行人體健康管理、藥企新藥研發(fā)等方面的應用。
不同于循證醫學(xué)和精準醫學(xué),計算醫學(xué)是一個(gè)全新的概念,高度依賴(lài)高性能的數據分析平臺,是建立在超算基礎之上的新興科學(xué)。計算醫學(xué)以計算技術(shù)為手段,醫學(xué)問(wèn)題為導向,構建各種生命活動(dòng)的模型,充分利用人類(lèi)已經(jīng)積累的生物醫學(xué)知識,系統地理解生物醫學(xué)大數據蘊含的生命規律。
中科院計算技術(shù)研究所20年經(jīng)驗孵化,超算上跑出計算醫學(xué)
中國在超算方面的成就中科院計算技術(shù)研究所(簡(jiǎn)稱(chēng):中科院計算所)位于第一梯隊,譚光明教授、張春明都是研究所里有著(zhù)20年超算經(jīng)驗的研究員。中科院計算所多年以來(lái)一直積極參與國家課題,為配合人類(lèi)基因組計劃,開(kāi)發(fā)了基因組學(xué)處理技術(shù),建立了基因數據計算模型、融合模型等等,基于這些年積累,作為計算所高性能計算機研究中心主任,超算鄰域的世界級科學(xué)家譚光明教授帶領(lǐng)團隊提出了計算醫學(xué)的概念。中科院計算所決定將研究成果以企業(yè)的方式落地,遂孵化出了北京哲源科技有限責任公司(簡(jiǎn)稱(chēng):哲源科技),將生物醫學(xué)數據處理方面的人工智能社會(huì )化應用,構建生命信息引擎,向臨床賦能。
除了前微醫高管趙宇負責公司商業(yè)化落地,公司背后技術(shù)實(shí)力強大,張春明副研究員、牛鋼博士是哲源科技的技術(shù)核心。牛鋼博士目前擔任圖靈·達爾文實(shí)驗室主任,曾經(jīng)主持分析了世界上最大的肝癌PDC數據項目。
構建生命信息引擎,成就醫學(xué)界的“英特爾芯片”,賦能全臨床
“循證醫學(xué)最大的特點(diǎn)是體現了群體的特征,但是卻永遠沒(méi)辦法知道藥物對具體某個(gè)人的實(shí)際療效如何。”哲源科技COO趙宇表示,“例如在判斷腫瘤用藥方面,我們需要大約25000個(gè)基因,例如針對乳腺癌的分類(lèi)和治療方案的選擇,可能就涉及三千多個(gè)基因,在目前實(shí)際場(chǎng)景中,如果說(shuō)患者沒(méi)有標志物,那么即便是精準醫學(xué)也束手無(wú)策,最后又回歸到循證醫學(xué)。” 而在計算醫學(xué)的方法論下,哲源科技不再是依賴(lài)某個(gè)單獨的基因作為判斷藥物療效的關(guān)鍵,也不局限于靶點(diǎn)和藥物之間的一對一單點(diǎn)的因果關(guān)系,而是系統性地看待生命,最終哲源均能夠給出用藥建議方案,用超算手段去挖掘驅動(dòng)找到新重點(diǎn),然后結合人工智能的方法做算法迭代輸出,去探尋整體機體體系間的相關(guān)關(guān)系,構建出一個(gè)生命信息引擎。
而訓練這個(gè)模型的數據體量,按趙宇的描述,已經(jīng)超過(guò)PB(1P=106G)量級,每次系統迭代都需要耗費千萬(wàn)級的電費。“生命信息引擎并非‘海市蜃樓’,我們已經(jīng)有部分成果在臨床上獲得了佐證。”趙宇告訴動(dòng)脈網(wǎng)。
就在最近,哲源科技通過(guò)生命信息引擎的子系統TWIRLS分析了世界上有關(guān)冠狀病毒的1.4萬(wàn)多篇文獻相關(guān)文本資料共計300萬(wàn)余單詞,在沒(méi)有任何臨床資源情況下,四小時(shí)就找到了新冠病毒導致“細胞因子風(fēng)暴”的潛在機制,進(jìn)而明確指出一個(gè)治療的新靶點(diǎn)。
無(wú)獨有偶,一個(gè)月后,這一計算醫學(xué)方法下的“紙上談兵”的研究結論,在3月25日Research Square平臺的一項由上海瑞金醫院病理科教授王朝夫、中國科學(xué)院院士卞修武等為通訊作者的論文中得以驗證。更在其后中國醫學(xué)科學(xué)院蔣澄宇團隊以及武漢大學(xué)基礎醫學(xué)院李紅良團隊分別回顧性研究中進(jìn)一步驗證。
生命信息引擎可以生動(dòng)地理解為醫學(xué)界的“英特爾芯片”,理論上可以為全醫療領(lǐng)域的各類(lèi)細分疾病進(jìn)行數字化模擬試藥,即便面對棘手的癌癥,計算醫學(xué)呈現出巨大的優(yōu)勢。
腫瘤之所以難以治愈,原因在于癌癥并非由單一的基因控制,而是由上萬(wàn)基因共同作用的結果,這些基因還會(huì )在體內突變、演化,并且都不是“孤軍奮戰”,相反他們作為通路形成“種群”,聯(lián)合去完成特定任務(wù)。攻克癌癥,就好比要去解析一個(gè)超級復雜的電子路線(xiàn)圖,試圖通過(guò)單基因的管控實(shí)現全癌癥治療難度可想而知。
哲源科技通過(guò)機器學(xué)習模型深度解讀腫瘤基因組全局性變異,評估腫瘤信號通路的激活狀態(tài),可對腫瘤進(jìn)行分期、評估原發(fā)灶起源、預測腫瘤進(jìn)展等情況,輔助醫生與患者選擇靶向藥物、化療藥物、免疫治療藥物,評估用藥療效。特別是針對一線(xiàn)及多線(xiàn)用藥失敗、基因檢測無(wú)可用藥提示、檢測到用藥變異但臨床效果不好、發(fā)生耐藥等腫瘤臨床疑難問(wèn)題,為醫生提供可用藥方案、輔助優(yōu)化后續臨床治療方案,實(shí)現腫瘤全程精準診療。
目前,哲源科技已經(jīng)有了多項臨床產(chǎn)品輸出,在臨床腫瘤方面,區別于目前存在的基因分析,哲源科技用計算醫學(xué)的方法,針對實(shí)體腫瘤復雜的二三線(xiàn)治療以及耐藥、轉移等情況,可以全部給出用藥建議,無(wú)空白、陰性報告,臨床有效緩解超過(guò)百分之八十。
在趙宇看來(lái),沒(méi)有失敗的藥物臨床三期試驗。“我們通過(guò)計算醫學(xué),在醫院場(chǎng)景下,要為人找藥,對藥企合作,則是為藥找人,要給藥裝上‘眼睛’,找到適合的患者。哲源科技可以幫助臨床試驗失敗的藥物找到新的適應癥,幫助藥企將巨額的投入成本撈回來(lái)。”
“在計算醫學(xué)方法下,我們已經(jīng)提出了與醫院,互聯(lián)網(wǎng)醫療,第三方醫學(xué)檢驗所三個(gè)醫療場(chǎng)景下的腫瘤治療解決方案,但我們仍然希望臨床醫學(xué)科學(xué)家,藥企研發(fā)團隊帶著(zhù)問(wèn)題與我們的技術(shù)合作,也希望將我們成熟的腫瘤臨床用藥建議產(chǎn)品豐富到各個(gè)基因檢測公司的產(chǎn)品線(xiàn)中去。”趙宇呼吁道。據悉,公司也啟動(dòng)了新一輪的融資計劃,主要用于科研團隊的擴增以及多場(chǎng)景的產(chǎn)品合作推進(jìn)。
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