近日,發(fā)表在《Nature》雜志上的一篇論文,革新了傳統蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù),研究者開(kāi)發(fā)出一種全新的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):泛素剪切,該技術(shù)幫助研究學(xué)者繪制有史以來(lái)清的泛素化作用圖譜,將一系列疾病的微妙變化與泛素信號傳導聯(lián)系起來(lái)。
泛素、泛素鏈與泛素化
泛素(ubiquitin) 圖片來(lái)源:維基百科
泛素(ubiquitin)是一種存在于大多數真核細胞中的小蛋白,大小為76個(gè)氨基酸殘基,其主要功能是標記需要分解掉的蛋白質(zhì),使其水解。
多樣的泛素間進(jìn)行連接便形成了多樣的泛素鏈結構。當泛素鏈與相關(guān)蛋白發(fā)生相互作用時(shí),可將底物蛋白導向蛋白酶體、溶酶體或其他信號通路,形成復雜的信號網(wǎng)絡(luò ),最終調控細胞的重要生命活動(dòng)。
泛素化系統 圖片來(lái)源:維基百科
而泛素化則是以泛素單體和泛素鏈作為信號分子,將泛素蛋白結合到底物蛋白質(zhì)分子的特定位點(diǎn)的過(guò)程。這一過(guò)程依次按泛素活化酶(E1)、泛素結合酶(E2)和泛素連接酶(E3)的順序反應,從而達到控制蛋白質(zhì)的半衰期和表達水平的目的。
泛素剪切:對泛素鏈結構下手
該研究的泛素信號傳導部門(mén)負責人David Komander教授表示:“泛素化可以改變蛋白質(zhì)的運作方式,潛在地改變它們的活性,將它們重新定向到細胞的不同部分,或者調節它們與其他蛋白質(zhì)的相互作用。作為其重要組成部分的泛素鏈由于“結構”不同也可以影響對蛋白質(zhì)修飾。截止目前,研究人員幾乎無(wú)法檢測和區分不同的分支結構。”
于是,來(lái)自Walter和Eliza Hall研究所的研究人員們對泛素鏈結構“下手”了。一項全新的“泛素剪切”技術(shù)橫空出世,科學(xué)家們可以借助這一工具來(lái)測量蛋白質(zhì)樣品中的多樣泛素鏈結構,高清了解泛素化細節,從而通過(guò)質(zhì)譜技術(shù)分析,得出的結果更加精準。
Komander教授對這一技術(shù)的開(kāi)發(fā)表示十分肯定,他說(shuō):“泛素剪切是一項革命性的技術(shù),它不僅簡(jiǎn)化了泛素的研究,使實(shí)驗細節達到歷史新高,還能使我們能夠揭示更為完整的泛素信號傳導的復雜性水平。”
小分子藥物開(kāi)發(fā)的全新技術(shù)
泛素化過(guò)程的改變可能會(huì )影響到一系列疾病的產(chǎn)生,例如癌癥、炎癥性疾病、帕金森病等神經(jīng)退行性疾病等。目前,Komander教授與其同事Rebecca Feltham博士正將泛素剪裁技術(shù)應用到類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節炎(一種復雜的炎癥性疾病)患者的臨床樣本中,以尋找蛋白質(zhì)泛素化模式的變化。
Komander教授表示:泛素化將成為新藥開(kāi)發(fā)的一個(gè)有希望的靶點(diǎn)。在此次研究中也將是我們團隊藥物發(fā)現研究的一個(gè)關(guān)鍵方面。我期待著(zhù)著(zhù)這一項技術(shù)可以創(chuàng )造出更多令人興奮的發(fā)現。
參考資料:
[1] Insights into ubiquitin chain architecture using Ub-clipping
[2] 泛素、泛素鏈和蛋白質(zhì)泛素化研究進(jìn)展
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