腸道病毒crAssphage解鎖旅行打卡新技能

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來(lái)源：生物探索

2019-07-11

圣地亞哥州立大學(xué)的生物信息學(xué)研究員Rob Edwards教授帶領(lǐng)的研究團隊發(fā)現，一種叫做crAssphage的腸道病毒存在于全球70%的人口中，是一種具有特定國家的生物標志物。

旅行可以開(kāi)拓眼界，也可以改變腸道結構。

圣地亞哥州立大學(xué)的生物信息學(xué)研究員Rob Edwards教授帶領(lǐng)的研究團隊發(fā)現，一種叫做crAssphage的腸道病毒存在于全球70%的人口中，是一種具有特定國家的生物標志物。當人類(lèi)從一個(gè)地方旅行到另一個(gè)地方時(shí)，這種標志物會(huì )迅速發(fā)生變化。他們的研究還表明，crAssphage的其它亞型生活在靈長(cháng)類(lèi)動(dòng)物中，可能與人類(lèi)一起進(jìn)化了數百萬(wàn)年。這是全球第一個(gè)針對病毒在人類(lèi)微生物組中全球相似性的研究，結果發(fā)表在《Nature Microbiology》雜志上。

數字科學(xué)

Edwards和他的同事在2014年通過(guò)使用計算機軟件而不是培養皿分析糞便樣本發(fā)現了crAssphage的存在。這種數據驅動(dòng)的方法表明，crAssphage不僅是“一個(gè)良性的環(huán)球旅行者”，而且是“正常人類(lèi)腸道病毒的一個(gè)組成部分”。

全球crAssphage 寶可夢(mèng)

Edwards向科學(xué)界發(fā)出挑戰，邀請他們加入到對crAssphage的全球尋寶行動(dòng)中來(lái)。

反響非常熱烈：來(lái)自六大洲65個(gè)國家的117名研究人員、臨床醫生和學(xué)者共同分析了32,273種不同的crAssphage序列，發(fā)現crAssphage也被稱(chēng)為噬菌體，是一種特異性感染細菌的病毒，是“人類(lèi)腸道的世界性居民”。

這一發(fā)現的關(guān)鍵是由來(lái)自世界各地的志愿者組成的科學(xué)團體，他們通過(guò)檢測本國污水處理廠(chǎng)、河流、湖泊和池塘的水，幫助實(shí)現了這一目標。

助力個(gè)性化醫療

Edwards說(shuō)：“這一發(fā)現說(shuō)明了病毒如何在地球上傳播，并反映在我們的微生物群落中。我們才剛剛開(kāi)始觸及表面，但最終，我們可能能夠操縱微生物群來(lái)攻擊有害細菌。這將是邁向個(gè)性化醫療的關(guān)鍵一步。”

參考資料：

[1] A common gut virus that maps our travels

[2] Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage

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