細菌通過(guò)次級代謝產(chǎn)生具有生物活性的抗生素從而清除異己,爭奪環(huán)境中的資源,那抗生素產(chǎn)生菌如何避免抗生素對自身產(chǎn)生傷害呢?近期,中國科學(xué)院上海有機化學(xué)研究所生命有機化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室研究員唐功利課題組在高活性天然產(chǎn)物萘啶霉素(NDM)的生物合成研究過(guò)程中,發(fā)現了一個(gè)分泌型、FAD依賴(lài)的氧化還原酶NapU在胞外氧化無(wú)活性前體生成具有生物活性的萘啶霉素,隨后還可以進(jìn)一步氧化萘啶霉素使其失活。相關(guān)成果近期發(fā)表在《美國國家科學(xué)院院刊》上(PNAS 2018,115:11232-11237)。
萘啶霉素屬于四氫異喹啉家族天然產(chǎn)物,該家族抗生素因其良好的抗腫瘤和抗菌活性備受研究者們的關(guān)注。它們均具有藥效官能團——半縮醛胺,其中羥基通過(guò)質(zhì)子化脫水,伴隨氮原子給出孤對電子形成親電性亞胺物種,形成亞胺的碳原子易被鳥(niǎo)嘌呤中的N-2位親核進(jìn)攻從而有效地烷基化DNA。
基因敲除發(fā)現基因napU失活的突變株發(fā)酵產(chǎn)生無(wú)半縮醛胺羥基的中間體5。體外酶活測試表明NapU能迅速氧化化合物5生成NDM (1);而隨著(zhù)反應時(shí)間的延長(cháng),NDM緩慢地轉化為具有酰胺結構的化合物7。通過(guò)對野生型萘啶霉素產(chǎn)生菌的發(fā)酵產(chǎn)物進(jìn)行時(shí)間梯度監測,發(fā)現發(fā)酵產(chǎn)物NDM和化合物7的產(chǎn)量變化與體外酶活測試結果一致。以大腸桿菌作為測試菌,發(fā)現化合物5和7的活性遠遠低于NDM。
基于這些實(shí)驗結果,該團隊提出這種胞外氧化活化產(chǎn)生抗生素和進(jìn)一步氧化失活過(guò)程可能是產(chǎn)生菌的一種自抗性機制。隨后結合突變和標記實(shí)驗提出了可能的反應機理;通過(guò)Western-Blot和蛋白質(zhì)譜方法對野生型菌株表達的分泌蛋白NapU進(jìn)行捕捉和定量,質(zhì)譜成像顯示與中間體及產(chǎn)物存在顯著(zhù)時(shí)空相關(guān)性;而表達NapU的大腸桿菌對NDM顯示明顯的抗性。該研究揭示了一種原核生物罕見(jiàn)的“胞內藥效團失活-前藥外泌與成熟-胞外藥效團再生-宿主周邊活性抗生素濃度調控”復雜而精巧的時(shí)空隔離自抗性機制,進(jìn)一步暗示了鏈霉菌富含復雜多樣的胞外生理與生化。
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