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基因組算法立功!發(fā)現(xiàn)膀胱癌新靶點

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來源:藥明康德
  2018-07-09
膀胱癌是美國第六常見的癌癥,根據(jù)美國癌癥學會(ACS)的統(tǒng)計,2017年美國約有79000人被診斷為膀胱癌,將近17000人死于這種疾病。

       

       膀胱癌是美國第六常見的癌癥,根據(jù)美國癌癥學會(ACS)的統(tǒng)計,2017年美國約有79000人被診斷為膀胱癌,將近17000人死于這種疾病。在過去幾年中,逐漸形成了根據(jù)基因表達模式對膀胱癌進行分類的趨勢。已知一種稱為p53樣膀胱癌(p53-like bladder cancer)的基因表達模式與侵襲性的肌肉浸潤性疾病相關,但人們尚不清楚該亞型對患者預后有何影響。現(xiàn)在,紐約西奈山衛(wèi)生系統(tǒng)(Mount Sinai Health System in New York)的研究者通過算法模型,確定了兩種生物標志物,它們有可能幫助腫瘤學家預測p53樣膀胱癌患者的預后,并對其進行針對性治療。相關論文發(fā)表在近期的《Oncogene》上。

       據(jù)ACS統(tǒng)計,肌肉浸潤性膀胱癌的5年生存率為63%。患者對常規(guī)治療(如化療)的反應可能差異很大,因此需要有新的療法來治療這種疾病。近年來,使用免疫檢查點抑制劑的免疫療法成為膀胱癌治療的重大進展,但是一些患者變得耐藥。去年,羅氏(Roche)發(fā)現(xiàn)一種名為TGF-β的蛋白質(zhì)與患者對PD-L1抑制劑Tecentriq的反應相關,如果將Tecentriq與抗TGF-β化合物聯(lián)用,可以提高其有效性。

       這次來自西奈山團隊的研究確定了兩種基于microRNA活性的p53樣膀胱癌生物標志物。p53樣膀胱癌的命名來自與其相關的活性基因特征。它通常特別具有侵略性,并且對標準化療耐藥,但個體預后可能會有很大差異。microRNA則是一種調(diào)節(jié)基因表達的遺傳物質(zhì)。研究者利用他們之前開發(fā)的計算模型“ActMiR”開展研究,它能根據(jù)基因表達的變化確定microRNA的活性。研究者用ActMiR分析了癌癥基因組圖譜(Cancer Genomic Atlas)中的膀胱癌數(shù)據(jù),從中發(fā)現(xiàn)了兩種microRNA,它們在p53樣膀胱癌中有抑癌的作用,其中一種與患者更好的存活率相關。在用ActMiR分析膀胱癌數(shù)據(jù)之前,西奈山團隊已經(jīng)用多種類型乳腺癌的數(shù)據(jù)作過驗證。

       雖然現(xiàn)在還處于早期階段,西奈山的研究者相信這個研究結(jié)果暗示了靶向microRNA有潛力成為膀胱癌新療法。其他研究者也在探索調(diào)控microRNA這個策略,比如倫敦帝國理工學院(Imperial College London)的研究者就在研究可以控制乳腺癌和肺癌的細胞遷移和生長的microRNA。

       西奈山的研究者表示還需要做更多的研究,來確定這次發(fā)現(xiàn)的兩種生物標志物對于p53樣膀胱癌患者個體化治療的意義。“我們的算法不僅讓我們深入了解了這種難以捉摸的膀胱癌的潛在細胞機制,而且還揭示了microRNA作為治療靶點的潛力,”西奈山遺傳和基因組學教授朱軍博士評論說。

       

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