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Nature:細菌進(jìn)行基因改造后能替代藥物對抗疾病嗎?

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來(lái)源:生物探索
  2018-06-29
生病時(shí),人們通常會(huì )靠吃藥來(lái)清除體內有問(wèn)題的細菌。但現在,科學(xué)家們正試圖開(kāi)發(fā)一種反人類(lèi)直覺(jué)的新方法來(lái)對抗病菌——將基因改造后的工程菌轉化為新型“藥物”。相關(guān)實(shí)驗已逐步取得進(jìn)展。

       生病時(shí),人們通常會(huì )靠吃藥來(lái)清除體內有問(wèn)題的細菌。但現在,科學(xué)家們正試圖開(kāi)發(fā)一種反人類(lèi)直覺(jué)的新方法來(lái)對抗病菌——將基因改造后的工程菌轉化為新型“藥物”。相關(guān)實(shí)驗已逐步取得進(jìn)展。

       利用細菌提供基因療法的想法最早出現在20世紀90年代,不過(guò),早期臨床試驗的結果好壞參半。近年來(lái),隨著(zhù)越來(lái)越多的證據表明,人體內的微生物群可以影響人類(lèi)健康,人們對這種方法的興趣有所增加。研究人員開(kāi)始試圖通過(guò)改變人體或食物中常見(jiàn)的微生物來(lái)治療疾病。

       目前,幾家公司正在測試工程菌(engineered bacteria)是否能夠治療影響大腦、肝 臟和其他器官的疾病,甚至殺死其他有害微生物。盡管美國監管機構已批準對幾種工程菌進(jìn)行試驗以作為基因治療的一種形式,但微生物共享DNA的能力是否會(huì )產(chǎn)生長(cháng)期安全風(fēng)險仍是個(gè)問(wèn)題。

       新加坡國立大學(xué)的合成生物學(xué)家Matthew Chang認為,轉基因細菌有潛力治療多種疾病。他的團隊正在設計腸道細菌大腸桿菌和乳酸菌,以識別和破壞有害的微生物。目前,他正在與新加坡監管機構討論開(kāi)展臨床試驗。

       部分實(shí)驗

       其中一項研究旨在治療遺傳性苯丙酮尿癥。患有這種疾病的人缺乏分解氨基酸苯丙氨酸的酶,如果苯丙氨酸在體內積聚,就會(huì )導致神經(jīng)損傷。本月早些時(shí)候,在亞特蘭大市舉行的美國微生物學(xué)會(huì )年會(huì )上,劍橋市生物技術(shù)公司Synlogic的研究人員報告說(shuō),大腸桿菌經(jīng)過(guò)改造,產(chǎn)生了一種降解苯丙氨酸的酶和一種將苯丙氨酸從血液轉移到細胞的蛋白質(zhì),與對照組動(dòng)物相比,猴子血液中的該氨基酸 水平降低了一半以上。

       公司首席執行官Aoife Brennan說(shuō),他們于4月份開(kāi)始對健康志愿者進(jìn)行臨床試驗,一旦確定治療是安全的,將立即開(kāi)始對苯丙酮尿癥患者進(jìn)行細菌檢測。同月,Synlogic開(kāi)始對制造酶的工程大腸桿菌進(jìn)行試驗,以清除代謝性肝病患者血液中氨的**積聚。

       另一家馬里蘭州的公司Intrexon改造了奶酪生產(chǎn)中使用的乳酸鏈球菌,以制造一種保護皮膚外層的蛋白質(zhì)。目前正在進(jìn)行的一項臨床試驗已招募了大約200名癌癥患者,他們被用來(lái)測試乳酸鏈球菌漱口水是否能預防化療副作用引起的口腔潰瘍。7月份,該公司將開(kāi)始給糖尿病患者服用不同形式的乳酸鏈球菌,這種乳酸鏈球菌既能產(chǎn)生人類(lèi)胰島素前體,又能產(chǎn)生增強細胞對胰島素反應能力的免疫蛋白。

       總的來(lái)說(shuō),Invexon和Synlogic都設計了細菌,以降低它們在體內建立菌落的可能性。病人會(huì )定期服用改良過(guò)的微生物,以確保它們產(chǎn)生的治療分子劑量一致。但其他公司則正在尋求另一種治療方法,以在體內產(chǎn)生轉基因細菌菌落。

       來(lái)自加州的生物技術(shù)公司Osel計劃在今年晚些時(shí)候向美國政府申請批準一株乳酸菌,這種乳酸菌已經(jīng)被設計成可以防止HIV傳播。研究表明,陰道中天然高含量的乳酸菌有助于保護婦女免受HIV感染。Osel正試圖通過(guò)使細菌攜帶一種防止HIV感染免疫細胞的人類(lèi)蛋白質(zhì)來(lái)增強其保護特性。

       安全問(wèn)題

       需要強調的是,在這些工程菌進(jìn)入市場(chǎng)之前,挑戰依然存在。Brennan指出,由于它們的作用不如藥物直接,因此科學(xué)家仍需更好地了解細菌是如何與身體相互作用的。

       微生物之間的互作有可能將人類(lèi)基因傳遞給體內的其他細菌,引發(fā)一些不可預知的結果。對此,幾家公司試圖通過(guò)改變細菌的染色體來(lái)防止這種交換。他們還內置了生物“殺死開(kāi)關(guān)”( kill switches),以阻止微生物在體外存活。

       然而,這種策略可能會(huì )失敗。由英國東安格利亞大學(xué)免疫學(xué)家Simon Carding領(lǐng)導的一個(gè)小組,通過(guò)調節免疫系統,改造擬桿菌(Bacteroides ovatus)來(lái)治療結腸炎:該小組試圖通過(guò)使細菌依賴(lài)于由天然腸道細菌產(chǎn)生的胸腺嘧啶核苷(thymidine)來(lái)阻止細菌在體外存活。

       但是在科學(xué)家將細菌喂給小鼠72小時(shí)后,他們發(fā)現B. ovatus已經(jīng)將其被修改的基因傳遞給了動(dòng)物腸道里的其他微生物,并且獲得了使其能夠在沒(méi)有胸腺嘧啶核苷(thymidine) 的情況下存活的基因。

       這一經(jīng)驗促使Carding放棄了將細菌作為治療手段的努力。“如果控制不當,可能有害。”他說(shuō),“若無(wú)法控制其他細菌獲得這種外源基因的話(huà),其他細菌也可能會(huì )產(chǎn)生這種蛋白質(zhì)。"

       Synlogic、Osel等公司表示,他們從未觀(guān)察到這種類(lèi)型的基因轉移,但也承認這一現象的存在。Chang說(shuō):“這些微生物非常聰明,它們知道如何生存。工程菌是在體內“定居”(colonize) 還是快速死亡仍有待觀(guān)察,但隨著(zhù)目前的一系列臨床試驗在未來(lái)幾年相繼結束,答案很快會(huì )浮出水面。”

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