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CRISPR和這三家初創(chuàng )生物技術(shù)公司,能消滅上萬(wàn)種疾病嗎?

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  2018-03-02
讓我們閉上眼睛想象一下未來(lái):編輯一個(gè)基因就能治愈某種嚴重的疾病,人類(lèi)因此消滅了上萬(wàn)種疾病。

       2016年在美國上市的3家初創(chuàng )生物技術(shù)公司——CRISPR Therapeutics,Intellia Therapeutics和Editas Medicine堅信,這樣的夢(mèng)想在不久后將成為現實(shí)。它們的信仰背后,是一個(gè)看似簡(jiǎn)單的產(chǎn)品模式:改變特定基因可以產(chǎn)生治愈性的藥物。

       Intellia公司前首席執行官Nessan Bermingham博士表示,大約有5000種疾病可以通過(guò)替換某種目標基因來(lái)治愈。而世界衛生組織給出的數據更大,認為這樣的單基因疾病大約有10000種。

       “人們談?wù)摚▊€(gè)體化醫學(xué))已經(jīng)有20年,但從來(lái)沒(méi)有一種技術(shù)平臺讓我們實(shí)現這一點(diǎn),” Bermingham博士去年底離開(kāi)Intellia公司時(shí)曾表示:“這是有史以來(lái)第一次,我們可以通過(guò)一種技術(shù)實(shí)現這個(gè)目標,基于人們個(gè)體化的基因組數據。”

       這種技術(shù)就是CRISPR。這是一種更便宜、更高效的基因編輯方法,是推進(jìn)個(gè)體化醫學(xué)的關(guān)鍵。一些分析師認為,CRISPR技術(shù)是下一代大型生物技術(shù)公司誕生的平臺。

       什么是CRISPR基因編輯?

       CRISPR是一種稱(chēng)為聚集規則間隔短回文重復序列(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)技術(shù)的縮寫(xiě)。CRISPR技術(shù)產(chǎn)生的基礎是人類(lèi)基因組測序計劃的成功。2003年,在花費了27億美元巨資后,科學(xué)家繪制出第一個(gè)人類(lèi)基因組圖譜。從那之后,個(gè)人基因組測序的成本就急劇下降,并且有可能在未來(lái)幾年降低至幾百美元。此外,大數據分析技術(shù)也促進(jìn)了基因測序的發(fā)展。

       Bermingham博士談到,當第一個(gè)人類(lèi)基因組圖譜被繪制出來(lái)后,研究人員發(fā)現人體內編碼蛋白質(zhì)的基因只有20000個(gè)時(shí)非常“吃驚”。這比估計的10萬(wàn)基因數量少了太多!基本上,這些編碼蛋白質(zhì)的基因在遺傳語(yǔ)言中發(fā)揮了單詞的作用。研究人員還發(fā)現了最初認為沒(méi)有功能的DNA片段。這些DNA被爭議性地稱(chēng)為“垃圾DNA(junk DNA)”,不編碼蛋白質(zhì)。但是,事實(shí)證明,這些序列在調節基因表達方面發(fā)揮著(zhù)關(guān)鍵作用。

       總而言之,由于對人類(lèi)基因組知識的深入了解,這些生物技術(shù)公司才能夠利用CRISPR技術(shù)進(jìn)行產(chǎn)品研究和開(kāi)發(fā)。

       CRISPR技術(shù)是怎么工作的?

       目前大熱的CRISPR技術(shù)最早在大學(xué)里開(kāi)發(fā)成功,它使用一種被稱(chēng)為分子“剪刀”的DNA序列在特定位點(diǎn)對其他DNA序列進(jìn)行編輯。通過(guò)這種方式,生物技術(shù)公司就能夠編輯、增加或去除引發(fā)特定疾病的缺陷基因。

       “剪刀”有許多不同類(lèi)型。CRISPR Therapeutics,Intellia和Editas公司用的都是Cas9 CRISPR技術(shù)。據估計,Cas9可以編輯70%-80%的人類(lèi)基因組序列。要編輯更多的基因,治療更多的疾病,我們需要開(kāi)發(fā)其他新型的剪刀。

       ▲ARK Invest的分析師Manisha Samy女士(圖片來(lái)源:ARK Invest官方網(wǎng)站)

       如果把基因看作是單詞,那么CRISPR技術(shù)就是一種文字處理器。ARK Invest的分析師Manisha Samy女士認為:“CRISPR基因編輯技術(shù)類(lèi)似于具有‘查找’和‘刪除’這兩種功能的DNA文字處理器。另外,科學(xué)家還在研究一種基本的‘粘貼’功能,使CRISPR能夠插入適當的DNA代碼,從而修復基因突變。”

       事實(shí)上,基因編輯的概念并不新鮮。TALENs和鋅指核酸酶(zinc finger nucleases)這兩種技術(shù)已經(jīng)被人們廣泛用來(lái)進(jìn)行基因編輯。作為這兩種傳統基因編輯技術(shù)的代表,生物技術(shù)公司bluebird bio用的是某種TALENs技術(shù),而Sangamo Therapeutics用的是鋅指酶的方法。

       摩根大通證券分析師認為,CRISPR技術(shù)優(yōu)勢體現在它的易用。“CRISPR強大之處在于它使用起來(lái)非常簡(jiǎn)單。高中生在生物實(shí)驗室就能做基因敲除實(shí)驗。相比之下,鋅指酶技術(shù)需要大量的高端人才和時(shí)間。因此,CRISPR基因編輯系統非常強大。”

       CRISPR Cas9會(huì )引發(fā)人體免疫?

       雖然發(fā)展前景良好,但是關(guān)于CRISPR技術(shù)應用也有不同的聲音。

       今年1月,bioRxiv(一家在線(xiàn)服務(wù)商,存檔和發(fā)布生命科學(xué)領(lǐng)域未發(fā)表的研究報告)就曾發(fā)表了一篇論文,對CRISPR基因療法的持久性提出質(zhì)疑,認為人體可以對其產(chǎn)生免疫力。這篇文章指出,人類(lèi)免疫系統可能會(huì )對目前基因編輯中用得最多的Cas9酶產(chǎn)生抗性,從而導致科學(xué)原理上無(wú)效。

       雖然該論文尚未得到同行評審,但是許多涉及CRISPR技術(shù)的公司都在使用Cas9酶,這是CRISPR相關(guān)蛋白9(CRISPR associated protein 9)的縮寫(xiě)。Cas9產(chǎn)生于兩種人體內能快速引起感染的細菌,這意味著(zhù)一些免疫系統可能已經(jīng)對它們產(chǎn)生了免疫力。

       使用這種酶的CRISPR基因編輯是否會(huì )在這些患者中發(fā)揮作用?

       CRISPR Therapeutics公司認為,這要具體情況具體分析。當基因編輯在離體或在體外完成時(shí),Cas9酶會(huì )被降解,因此,當細胞重新輸入患者體內時(shí)基本上已經(jīng)不含有該酶。而對于體內應用,當基因編輯在體內完成時(shí),他們會(huì )采用幾種方法來(lái)確保Cas9酶瞬時(shí)表達。因此,CRISPRTherapeutics公司聲稱(chēng),“Cas9酶不會(huì )產(chǎn)生任何問(wèn)題。”

       ▲CRISPR Therapeutics的科學(xué)創(chuàng )始人和咨詢(xún)委員會(huì )成員Matthew Porteus博士(圖片來(lái)源:CRISPR Therapeutics官方網(wǎng)站)

       值得注意的是,bioRxiv這篇論文的首席研究員和作者正是CRISPR Therapeutics的科學(xué)創(chuàng )始人和咨詢(xún)委員會(huì )成員Matthew Porteus博士。

       Intellia公司稱(chēng)他們在嚙齒動(dòng)物和非人類(lèi)靈長(cháng)類(lèi)動(dòng)物中進(jìn)行的臨床試驗中,基因療法輸送系統沒(méi)有發(fā)現問(wèn)題。此外,Intellia還提到他們用的是Cas9酶的高級形式,并且研究中沒(méi)有一個(gè)供體之前就存在免疫力。這些數據都還是早期研究。

       那么采用其他的酶呢?Editas還用Cpf1酶。這種酶來(lái)源于其他細菌,可以克服Cas9帶來(lái)的一些免疫問(wèn)題。Editas在CRISPR基因組編輯的免疫反應方面做了一些研究,即將發(fā)表一篇相關(guān)論文。公司管理層表示,該研究發(fā)現免疫反應“比其他論文報道的要低得多”。

       總之,分析師和生物技術(shù)公司并沒(méi)有過(guò)分擔心,認為這不是個(gè)問(wèn)題,或者仍有時(shí)間在科學(xué)上找到解決方法。Samy女士說(shuō):“免疫反應并不罕見(jiàn),數十年來(lái),科學(xué)家一直在努力克服免疫識別,并且已經(jīng)有許多解決方案可以減少Cas9的潛在副作用,我們已經(jīng)在許多其他療法中證明了這一點(diǎn)。”

 

       生物技術(shù)公司如何使用CRISPR

       在一眾CRISPR生物技術(shù)公司中,CRISPR Therapeutics在新藥申請監管方面步伐領(lǐng)先。去年12月7日,其管線(xiàn)中的首個(gè)基因療法CTX001遞交了用于治療β地中海貧血的臨床申請。該臨床試驗將于2018年在歐洲進(jìn)行,受試者是成年患者。這有望成為基于CRISPR技術(shù)的基因編輯療法的首次人體試驗(first in-human trial)。CRISPR Therapeutics還計劃2018年在美國遞交用CTX001治療鐮狀細胞疾病的臨床試驗申請。

       CRISPR Therapeutics也已經(jīng)與Vertex達成合作,共同開(kāi)發(fā)治療β地中海貧血以及鐮狀細胞疾病的基因療法,這些合作是其體外基因療法計劃的一部分。在體外計劃中,基因編輯先在人體外的細胞里完成,然后再將細胞回輸到患者體內。此外,這家新銳也在研究肝 臟,肌肉和肺部等疾病的體內基因療法。

       Intellia在基因編輯方面也有體內和體外項目,針對的也是鐮狀細胞疾病。此外,還跟Regeneron(再生元)合作研發(fā)轉甲狀腺素蛋白淀粉樣變性(transthyretin amyloidosis)的基因療法,這種疾病的特征是全身性異常蛋白質(zhì)沉積。Alnylam和Ionis兩家醫藥公司也正在采用不同的方法,分別稱(chēng)為RNA干擾和反義技術(shù),來(lái)治療這種疾病。

       Editas正在研究Leber先天性黑蒙的遺傳性眼病(Leber congenital amaurosis)的基因編輯療法,這是一種出生時(shí)導致視力嚴重喪失的疾病。同樣,鐮狀細胞疾病和β地中海貧血也是Editas針對的疾病領(lǐng)域。

       分析師預計,Intellia和Editas將于2018年開(kāi)始人體試驗。

       ▲CRISPR Therapeutics首席執行官Sam Kulkarni博士(圖片來(lái)源:CRISPR Therapeutics官方網(wǎng)站)

       CRISPR Therapeutics首席執行官Sam Kulkarni博士認為,監管機構對基因編輯的態(tài)度越來(lái)越開(kāi)放。基因編輯的好處,同時(shí)也是潛在的挑戰——就是它意味著(zhù)永久性的修復。這些生物技術(shù)公司正在努力確保每次基因編輯都能“擊中靶心”。

       他說(shuō):“我們已經(jīng)能夠進(jìn)行基因編輯,并且使用分子的郵政編碼(醫藥行業(yè)稱(chēng)為“靶標”)以精確的方式進(jìn)行編輯,不會(huì )發(fā)生偏差。我們可以制造出高質(zhì)量、符合藥理學(xué)的基因編輯產(chǎn)品。”

       CRISPR生物技術(shù)公司的未來(lái)

       CRISPR Therapeutics首席執行官Kulkarni博士和Intellia公司前首席執行官Bermingham博士都表示,該領(lǐng)域具備三足鼎立的空間。

       分析師Samy女士則認為,定義市場(chǎng)容量是一個(gè)挑戰。無(wú)論如何劃分,市場(chǎng)都很大,而且很大程度上取決于公司針對的疾病類(lèi)型。如果CRISPR技術(shù)能夠治療每年新診斷的所有單基因疾病,再加上現有的患者,這帶來(lái)的潛力是巨大的。

       “一種產(chǎn)品不會(huì )治愈所有疾病。CRISPR領(lǐng)域能夠容納更多公司。”

       Kulkarni博士說(shuō):“CRISPR絕對稱(chēng)得上是生物醫藥領(lǐng)域劃時(shí)代的進(jìn)步,上一次是抗體藥物的發(fā)現。基因泰克(Genentech,Roche的子公司)正是在上一波技術(shù)浪潮中崛起的。”

       “現在,CRISPR平臺有望打造下一個(gè)大型生物技術(shù)王國。”

       參考資料:

       [1] Can CRISPR And These 3 Small Biotechs Cure 10,000 Diseases?

       [2] CRISPR Therapeutics官網(wǎng)

       

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