【新型基因組平臺揭示了新的HIV目標】來自斯坦福大學的研究人員開發(fā)了首次高通量、基于基因組的成像方法來研究蛋白質的穩(wěn)定性。該方法已被用于鑒定HIV降解以增強其感染過程的幾種未知的人類蛋白質。該平臺被稱為全球陣列蛋白穩(wěn)定性分析(GAPSA),能夠識別驅動細胞中蛋白質的破壞的電路,并且具有廣泛的應用,以鑒定用于諸如阿爾茨海默病、癌癥、自身免疫性疾病和感染性疾病的全新治療目標。這項研究今天發(fā)表在《細胞報告》中。
研究人員表示:“我們已經使用GAPSA來發(fā)現HIV-1輔助蛋白Vpu靶向的宿主蛋白,這是病毒復制的關鍵,我們選擇VPU作為測試用例,因為盡管已知一些VPU目標,但我們懷疑有更多的VPU目標。事實上,GAPSA能夠確定幾種具有抗病毒活性的宿主蛋白,這些蛋白沒有與HIV相關報道。”
VPU是針對先天免疫反應的HIV的武器,是身體對病原體的第一道防線。VPU觸發(fā)了防止HIV感染的宿主蛋白的降解,從而幫助病毒克服感染和復制的障礙。
“在這項研究中,我們篩選了一組433個干擾素刺激基因(ISG),針對感染,針對VPU激活的基因,建立更全面的HIV細胞目標列表。鑒定VPU靶蛋白可為尋找阻斷相互作用、潛在地保留宿主抗病毒蛋白和限制HIV感染的新藥物創(chuàng)造機會。重要的是,該系統同樣適用于其它逃避免疫系統的傳染病,如埃博拉、流感等。”
“根據我們的知識,Gaspan是第一個以細胞為基礎的陣列平臺,用來篩選蛋白質的構建和周轉。除了提供細胞工作原理的關鍵知識外,還可以應用該技術來鑒定特異性靶向致病蛋白的蛋白降解物,這可以為多種疾病提供新的治療機會。
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