今日,知名學(xué)術(shù)刊物《自然》背靠背在線(xiàn)刊發(fā)了兩篇重磅論文,報道了在兒童中進(jìn)行的首次泛癌癥基因組分析。這些分析對于了解兒童與成人的癌癥區別有著(zhù)很重要的意義,并有望為兒童帶來(lái)更為精準的療法。我們很高興看到St. Jude兒童研究醫院的Jinghui Zhang教授主導了其中的一項研究。
▲該研究的通訊作者Jinghui Zhang教授(前排)與兩名共同一作Xiaotu Ma和Yu Liu博士(后排)(圖片來(lái)源:Peter Barta / St. Jude Children's Research Hospital)
我們都知道,成人的癌癥往往由多種遺傳變異引起。這些變異積少成多,量變帶來(lái)質(zhì)變,最終誘使癌癥的出現。然而我們也知道,兒童癌癥與成人癌癥在類(lèi)型、嚴重程度、康復率等方面都有著(zhù)很多不同。這背后有著(zhù)怎樣的原因??jì)和c成人的癌癥在根源上會(huì )不會(huì )就有所不同?
為了回答這個(gè)問(wèn)題,Jinghui Zhang教授的課題組決定從基因組層面尋找答案。他們在1699名兒童癌癥患者中取得了腫瘤樣本與健康組織的樣本,并使用了多種下一代測序技術(shù),尋找兩者基因組中存在的不同。值得一提的是,這些兒童患者患有六種不同的癌癥,具有很好的代表性。
具體說(shuō)來(lái),這些科學(xué)家們通過(guò)全基因組測序,分析了樣本中的DNA拷貝數與染色體重排數據;此外,他們也通過(guò)轉錄組測序,比較腫瘤細胞與健康細胞內的基因表達情況。據信,這是在多種癌癥類(lèi)型中,首次對突變型和野生型等位基因表達情況進(jìn)行全面的定量與定性分析與評估。
“跨多個(gè)腫瘤類(lèi)型的研究,能讓我們找到在兒童癌癥中真正重要的突變,并理解背后的通路。” Zhang教授說(shuō)道。
▲兒童癌癥中前100大復發(fā)突變基因,星號表明在成人泛癌癥研究中未曾被闡明的基因(圖片來(lái)源:《自然》)
研究揭示了一些讓所有人都感到驚訝的結果。舉例來(lái)說(shuō),在689名患有B細胞急性淋巴性白血病的患者中,有8名患者的DNA突變類(lèi)型與紫外線(xiàn)照射引起的突變相一致,而這些突變類(lèi)型之前只在皮膚癌中有所呈現。“這些發(fā)現表明,紫外線(xiàn)照射可能讓部分兒童罹患白血病的風(fēng)險上升,而這是之前未經(jīng)闡明的環(huán)境因素!”該研究的作者之一Ludmil Alexandrov博士說(shuō)道。
此外,研究人員們從結果中也注意到,兒童患者的主要致癌因素是拷貝數異常,或是DNA結構的改變。這些因素占到了62%,高于大家普遍認為的DNA點(diǎn)突變。從機理上看,拷貝數異常會(huì )讓患者產(chǎn)生過(guò)多或過(guò)少的特定基因,而DNA結構改變則會(huì )造成基因的重排。“這表明在臨床診斷時(shí),我們要檢測兒童患者的拷貝數變化以及DNA結構改變。” Zhang教授評論說(shuō)。
▲《自然》雜志對這兩項研究進(jìn)行了專(zhuān)文評論(圖片來(lái)源:《自然》)
綜合今日背靠背發(fā)表的兩項研究,《自然》雜志在特約評論中指出,兒童癌癥與成人癌癥有三大不同:首先,兒童癌癥的基因突變率更低;其次,兒童癌癥更多是由單基因驅動(dòng);第三,導致兒童癌癥的變異,往往只針對特定的癌癥。這不像成人的癌癥那樣,不同癌癥可以擁有同樣的突變。
▲成人癌癥與兒童癌癥有著(zhù)很大不同(圖片來(lái)源:《自然》)
更值得關(guān)注的是,催生兒童癌癥的基因,與導致成人癌癥的基因有著(zhù)極大不同。Zhang教授團隊發(fā)現,兩者的重合率只有45%,不足一半。在另一項研究里,這個(gè)數字更是只有30%。
“這項研究首次表明,兒童與成人的癌癥是由不同基因的不同突變引起的,” Zhang教授說(shuō)道:“這些結果讓我們了解到,兒童癌癥患者不是成人患者的‘縮小版’,他們的疾病應該得到不同的處理。只有對兒童癌癥的生物學(xué)原因有足夠的理解,才能帶來(lái)更好的治療方案與更靈敏的檢測手段。這些研究結果為科研人員們提供了探索的地圖。”
為了更好地為兒童患者帶來(lái)治療,研究人員們決定將他們得到的基因、變異、細胞通路等數據公開(kāi),方便其他研究人員使用。我們感謝這些研究人員的分享**,也期待在兒童癌癥領(lǐng)域能見(jiàn)證更多突破,讓這些年輕的生命不至于早早夭折。
參考資料:
[1] Pan-cancer genome and transcriptome analyses of 1,699 paediatric leukaemias and solid tumours
[2] The landscape of genomic alterations across childhood cancers
[3] Landscapes of childhood tumours
[4] Genomic analysis underscores need for precision therapies that target pediatric cancer
合作咨詢(xún)
肖女士
021-33392297
Kelly.Xiao@imsinoexpo.com