達肝素鈉為豬腸黏膜肝素經(jīng)亞硝酸解聚得到的低分子肝素的鈉鹽。大多數(shù)成分含有非還原端2-Ｏ-sulfo-α-L-idopyranosuronic acid結(jié)構(gòu)，還原端6-Ｏ-磺基-2，5-脫水-D-甘糖酯結(jié)構(gòu)。平均相對分子量為5600～6400，特征性分子量值為6000.相對分子量低于3000的鏈低于13%（w/w），相對分子量高于8000的鏈所占為15%～25%（w/w）。每個二糖基團的硫酸鹽化程度為2.0～2.5。以干物質(zhì)計，每毫克的抗因子Ｘa活性效價為110～210Ｕ，抗因子Ｘa與抗因子IIa活性效價這比為1.9～3.2。
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